念珠的作用主要足帮助修行者收摄心意，消除妄念，专注修行。同时也使修行人完成每日规定的课诵不至懈怠，记数而用。《木槵子经》中，佛陀开示毗琉璃王曰佛告
王言。若欲灭烦恼障报障者。当贯木患子一百八。以常自随。若行若坐若卧。恒当至心无分散意。称佛陀达摩僧伽名。乃过一木患子。如是渐次度木患子。若十若二十。若百若千。乃至百千万。若能满二十万遍。身心不乱。无诸谄曲者。舍命得生第三焰天。衣食自然。常安乐行。若复能满一百万遍者。当得断除百八结业。始名背生死流。趣向泥洹。永断烦恼根。获无上果。《佛说校量数珠功德经》说若
菩提子为数珠者。或用掏念或但手持。数诵一遍其福无量。不可算数难可校量。诸善男子其菩提子者。若复有人手持此珠。不能依法念诵佛名及陀罗尼。此善男子但能手持随身。行住坐卧所出言语若善若恶。斯由此人以持菩提子故。得福等同如念诸佛诵咒无异。获福无量。《金刚顶瑜珈念珠经》中载金刚萨堙菩萨偈日：静虑思念心专注，念诸如来菩萨名，当获无量胜功德，所求胜愿皆成就。一粒粒念珠，圆润饱满，象征着菩萨圆满的正果。用线贯串起来，是表示菩萨的种种功德，串珠中的一粒母珠(俗称佛头)是表示佛陀的无量光明，无量寿的。念珠是串起来的，但也可以分开和断结，这表示以菩萨的种种功德来断除众生的种种烦恼。念珠又别有些人称之为栓马索，是比喻人心如狂奔的