按专业部门分类，环境监测可分为飞秒检测监测、卫生监测、气象监测和资源监测等。按污染物存在的介质分类（1）水质污染监测对地表水、地下水和底泥中的物理指标（色度、电导率、温度、悬浮物等）、化学指标（重金属、无机盐类、化学需氧量、生化需氧量、农药、挥发酚等）和生物学指标（细菌总数、大肠杆菌数）等进行监测。（2）大气污染监测对大气中的悬浮颗粒、二氧化硫、一氧化碳、汞等一次污染物和光化学烟雾等二次污染物进行定性和定量测定。（3）土壤污染监测对土壤中的重金属、农药残留量及其它有毒有害物质进行监测。（4）固体废弃物监测对工业有害固体废物和生活垃圾的毒性、易燃性、腐蚀性、重金属等指标进行监测。（5）生物污染监测当生物从环境中摄取营养时，水、空气、土壤中的污染物质随之进入生物体内。植物的监测项目大体与土壤监测项目类似，水生生物的监测项目依水体污染情况而定。（6）噪声污染监测现代工农业生产、交通运输业和生活噪声产生的污染日益严重，噪声污染的监测和噪声控制越来越受到人们的重视。（7）放射性污染监测。
按照监测目的分类（1）例行监测例行监测又称常规监测或监视性监测，是对指定的项目进行长期、连续的监测，以确定环境质量和污染源状况、评价环境标准的实施情况和环境保护工作的进展等，是环境监测部门的日常工作，其工作的质量是环境监测水平的标志。例行监测包括环境质量监测和污染源监督监测。环境质量监测基本上是采用各种监测网（如水质监测网、大气监测网等）在设置的测点上长期收集数据，用以评价环境污染的现状、污染程度及变化的趋势，以及环境改善所取得的进展等，从而确定一个区域、国家或全球的环境质量状况。污染源监督监测是为掌握污染源，监视和检测主要污染源在时间和空间的变化所采取的定期、定点的常规性监督监测，包括主要生产、生活设施排放的“三废”监测，机动车辆尾气监测，噪声、热、电磁波、放射性污染的监测等。（2）应急性监测应急监测又称特定目的监测，监测的内容和形式很多，除一般地面固定监测外，还有流动监测、低空航测、卫星遥测等。按照其特定的目的，主要指：①污染事故监测：在污染事故发生时进行应急监测，以确定污染物的扩散方向、速度和可能波及的范围，为污染的有效控制提供依据。例如，监测核动力事故发生时放射性物质危害的空间、油船石油溢出污染的范围、工业污染源意外事故造成的影响。②仲裁监测：当发生环境污染事故纠纷或在环境执法过程中发生矛盾时，进行仲裁监测，为执法部门、司法部门提供具有法律效力的数据。仲裁监测只能由国家指定的权威部门进行。例如，目前我国的排污收费中进行的监测，处理污染事故中进行的监测。③考核验证监测：包括人员、实验室的考核，方法的验证和污染治理工程竣工时的验收监测等。④咨询服务监测：为政府部门、生产部门和科研部门等提供的咨询性监测。如对新建企业进行环境评价时所进行的监测。⑤可再生资源的监测：如对土壤、植被草原和森林等自然资源的监测，监测土壤退化的趋势，热带雨林的变化，牧地的变化等。⑥健康监测：了解污染对人们健康的危害。这是一种非常重要的监测。西方国家多因掌握了这种监测数据和所发生的污染事件才使得政府采取严格的控制污染的措施。（3）科研监测科研监测又叫研究性监测，是针对特定目的的科学研究所进行的高层次监测。科研监测主要是通过监测找出污染物在环境中的迁移转化规律，研制监测环境标准物质，专项调查监测某环境的原始背景值，或参加某个项目的环境评价等。当收集到的数据表明存在环境问题时，还必须研究确定污染物对人体、生物体等各种受体的危害程度。
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