语文科目最大改变是名句名篇默写范围从广东卷的只有33篇变为全国卷64篇古诗文。
英语科目在分值上从135分调整为150分，2016年广东省沿用广东省“听说”的自主命题15分和全国卷的笔试部分120分，最后折算成150分。除此之外，2016年全国新课标和广东高考英语课考试不同点主要在于试卷结构及考试形式，广东卷更侧重真实情景运用，考查难度其实高于全国卷。也就是考全国卷，英语其实是变简单了。
以理科数学为例，选择题和填空题由原来的70分上升至80分；选做题的位置发生了变化，由填空题二选一变成解答题中的最后一个为三选一，学生较难应付的数列题难度有所下降，而方法论较为成熟的立体几何题难度有所提高。
在理科综合方面，全国卷的生物、化学再无让人纠结的双选题。物理科从考纲上看，全国新课标只需要学5本书，广东卷要学6本书，但每个知识点的要求都相同。从分值上看，全国卷对比广东卷，物理多出10分。从题型上看，物理是唯一考不定项选择的科目。
文科综合方面，在选考内容上有所不同。比如全国卷的地理选考内容有三个模块——旅游地理、自然灾害与防治、环境保护，试卷中每个模块设一道非选择题(选考题)，分值为10分。广东卷的地理考试选考内容为：城乡规划、环境保护，不单独出选考题。