首先，距离导致的运输和储存成本的增加，新疆地理位置确实偏远，物流欠发达，比如库尔勒的香梨运到北京。
需要从库尔勒运到乌鲁木齐，然后再从乌鲁木齐中专运到北京，即便走航空也要5天左右的时间，不仅仅是时间成本，运输成本也大大提高。
我们这里还没有考虑损耗的部分，加上又是一笔成本。种种原因，导致了新疆的农产品运到内地的价格整体偏高，而农户其实并没有得到较好的受益。
第二，新疆所有的农产品，虽然名气较高，但市场辨识度不高。大家都知道新疆的农产品好，但是卖到内地的农产品鱼龙混杂，没有标准的识别度。
第三，整个种植与销售的系统比较落后，没有统一的产业链整合，市场化程度很弱。比如觉得种枣赚钱，就整体都种枣去了，也无法预判下市场，调研下市场是否可以去化这么大量的产品。经过几年时间，枣园培育好了，枣子的市场又不好了，农民不可能把枣树砍掉，转种别的农场品，他们的抗风险能力是很弱的。这样就导致本地同质化成品恶性竞争，同时也导致了新疆农场品的单一结构，不够丰富，市场竞争力较低。
第四，新疆整体经济建设落后，无法形成有效的资本、人才和技术流入，导致相关产业链整体水平落后。
第五，过分追求增产，对农场品精细化种植不够，导致近几年有些农产品品质下降，从而影响整体新疆农场品的口碑。
其次，大家都知道新疆知名的农副特产就是红枣，葡萄干等干果。对于这些干果，因为他们比较容易保存，而且运输起来也十分方便，所以这些东西在全国范围内都十分畅销。但是新疆特有名的无花果、桑葚等水果，在内地则见得比较少。
因为这些水果一般都不易于存放，而且运输的过程路途遥远，这样一来水果到了运输目的地时，就会发现很多都已经坏了，无法售卖。
最后，新疆地区农产品的种植系统，相对于我国其他地区的系统比较落后，并没有统一的产业链。所以果农即使今年丰收了，也无法有很好的销售渠道。自然而然，新疆的农副特产也走不出新疆地区。
而且新疆的整体经济水平都比较落后，这也导致了新疆在农业的相关产业链方面整体的水平都十分落后，没有办法形成有效的资本流通。