木马的植入通常是利用了操作系统的漏洞，绕过了对方的防御措施（如防火墙）。中了特洛伊木马程序的计算机，因为资源被占用，速度会减慢，莫名死机（死机），且用户信息可能会被窃取，导致数据外泄..等情况发生。 对于一些常见的木马，如SUB7、BO2000、冰河等等，它们都是采用打开TCP端口监听和写入注册表启动等方式，使用木马克星之类的软件可以检测到这些木马，这些检测木马的软件大多都是利用检测TCP连结、注册表等信息来判断是否有木马入侵，因此我们也可以通过手工来侦测木马。
也许你会对硬盘空间莫名其妙减少500M感到习以为常，这的确算不了什么，天知道Windows的临时文件和那些乌七八糟的游戏吞噬了自己多少硬盘空间。可是，还是有一些现象会让你感到警觉，一旦你觉得你自己的电脑感染了木马，你应该马上用杀毒软件检查一下自己的计算机，然后不管结果如何，就算是杀毒软件告诉你，你的机器没有木马，你也应该再亲自作一次更深入的调查，确保自己机器安全。经常关注新的和出名的木马的特性报告，这将对你诊断自己的计算机问题很有帮助。
⑴当你浏览一个网站，弹出来一些广告窗口是很正常的事情，可是如果你根本没有打开浏览器，而览浏器突然自己打开，并且进入某个网站，那么，你要注意。⑵你正在操作电脑，突然一个警告框或者是询问框弹出来，问一些你从来没有在电脑上接触过的问题。
⑶你的Windows系统配置老是自动莫名其妙地被更改。比如屏保显示的文字，时间和日期，声音大小，鼠标灵敏度，还有CD-ROM的自动运行配置。
⑷硬盘老没缘由地读盘，软驱灯经常自己亮起，网络连接及鼠标屏幕出现异常现象。
这时，最简单的方法就是使用netstat-a命令查看。你可以通过这个命令发现所有网络连接，如果这时有攻击者通过木马连接，你可以通过这些信息发现异常。通过端口扫描的方法也可以发现一些弱智的木马，特别是一些早期的木马，它们捆绑的端口不能更改，通过扫描这些固定的端口也可以发现木马是否被植入。
当然，没有上面的种种现象并不代表你就绝对安全。有些人攻击你的机器不过是想寻找一个跳板。做更重要的事情；可是有些人攻击你的计算机纯粹是为了好玩。对于纯粹处于好玩目的的攻击者，你可以很容易地发现攻击的痕迹；对于那些隐藏得很深，并且想把你的机器变成一台他可以长期使用的肉鸡的黑客们，你的检查工作将变得异常艰苦并且需要你对入侵和木马有超人的敏感度，而这些能力，都是在平常的电脑使用过程日积月累而成的。
我们还可以通过软件来检查系统进程来发现木马。如利用进程管理软件来查看进程，如果发现可疑进程就杀死它。那么，如何知道哪个进程是可疑的呢?教你一个笨方法，有以下进程绝对是正常的：EXPLORER.EXE、KERNEL32.DLL、MPREXE.EXE、MSGSRⅥNTERNAT.EXE、32.EXE、SPOOL32.EXEIEXPLORE.EXE（如果打开了IE），而出现了其他的、你没有运行的程序的进程就很可疑了。一句话，具体情况具体分析。
