1.教学上 :遵义医学院保留了从南迁一直以来的严谨的教风与学风。考风抓得更紧，基本不允许学生作弊。学生动手能力强于贵阳医学院，曾获第三届全国临床技能大赛三等奖，西南西北赛区一等奖。在近两年全国基础医学设计大赛，遵医学子均有获奖，但贵阳医学院就没得过。说明教学质量还是强于贵阳医学院的。2007年教学评估遵义医学院得的是优，而贵阳医学院是良。遵医有两个国家级的教学实验中心分别是临床医学技能中心和虚拟医学实验中心。
2.学科建设上:药理学为国家重点（培育）学科，贵阳医学院就没有国家重点学科。但贵阳医学院有博士授予权（只是基础医学），这比遵义医学院要好。但是在自然科学基金获批数量上，遵义医学院已经连续五年位居贵州省高校的第二位。（除贵州大学）
3.从办学历史来讲:两校都是西南地区的老牌医学院，都是很早就获得硕士授权点的高校，这点比泸州医学院强多了（泸州医学院前身是大专院校，去百度就知道了。）听遵义医学院的一位老教授说，当时大连医学院南迁到遵义时就有教授102人，当时贵州所有高校教授加起来还要多一人，这足见其当时在西南地区医学界的实力。
4.从实习点看:实习对医学生很重要，贵阳医学院的实习点除省 人民医院和第一附属医院以外，其余全是比较垃圾（都是位于贵州省内的）。而遵义医学院，实习点有自己的附属医院（贵州省第一家三甲医院），贵州省人民医院，四川省人民医院，成都第二人民医院，成都铁路中心医院，大连大学中山医院。而珠海校区方面有中山市人民医院，佛山市人民医院，深圳中心医院，东莞市人民医院，中山大学第五附属医院，珠海市人民医院，北京航天总医院等等（广东是中国第一富省，医院实力绝对比贵州的强很多倍啊。）从实习点上看贵医就差遵医好多。
5.学校排名:有些综合排名贵阳医学院较遵义医学院高，但有些医学排名就遵义医学院高，个人觉得看排名没有意义，因为两所学校都不是重点大学（211,985），没有用人单位在意这个，考研就更没有了。考研除211,985外，其余学校的在你报考的导师眼中都一个样。
6.从学校未来的发展上看:贵阳医学院会升为贵州医科大学，但是遵义医学院也是肯定会获得博士点（已经获得省的博士立项）并升为遵义医科大学的。但是从长远看，遵义医学院在珠海也有其校区（西部唯一一所在发达地区拥有医学院的高校），假以时日遵义医学院必定发展为西南和华南地区，乃至整个南中国的一所医学名校。
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