1，国名党党务派别，有蒋介石为首的中央派（其中还有二陈兄弟的CC系，复兴社系），以胡汉民为首的广东系，以汪精卫为首的改组派，还有西山会议派。
2，军队系统派别，有蒋介石的中央军（内分何应钦系和陈诚的土木工程系），张学良为首的东北军，阎锡山为首的晋绥军，冯玉祥为首的西北军（即大西北军），李宗仁，白崇禧，黄绍紘的桂系军队，湘军（早期3大派系，即谭延闿系，程潜系，唐生智系，后来前两系瓦解，唐系演变成以何健为首的新湘军），滇军（早期领袖龙云，后期首领卢汉），粤军（旧粤系领袖李济深，后被陈济棠取代，陈被蒋解决后，大部分由余汉谋统率，还有张发奎，吴奇伟，薛岳
3个小派系自成一系），川军（早期有刘文辉，刘湘，邓锡侯，潘文华，杨森，刘存厚6大派系，后来刘湘死后，其部分裂成王陵基，唐式遵等部，而刘存厚去职后，所部被孙震领有）。此外还有盘踞西北的马家军（占据青海的马步芳，马步青兄弟为青马，占据宁夏的马鸿逵，马鸿宾兄弟为宁马），占据贵州的黔军（以王家烈为首），占据陕西的杨虎城的17路军（亦称小西北军），占据新疆的盛世才军队。此外比较小还有从大西北军叛变出来的占据山东的韩复榘部，从李济深粤军中分裂出来的19路军，首领为陈铭枢，蒋光鼐，蔡廷锴。被蒋介石在北伐中收编的原张宗昌的直鲁联军残部演变而来的徐源泉部，方振武部，上官云相部等。
3，国民党中央特务系统，早期是三大派，即二陈CC系把持的中央党部组织部党务调查科，主任徐恩曾，总干事张冲。邓文仪任科长的南昌行营调查科，还有就是戴笠任处长的复兴社特务处。后来邓文仪因南昌机场失火事件调查不力被撤职，南昌行营调查科并入复兴社特务处。抗战爆发后，CC系的党务调查科改组为中统，复兴社特务处改组为军统。军统内戴笠之下还有以郑介民为首的广东派，毛人凤为首的浙江派，唐纵为首的湖南派。抗战胜利后，中统改为党通局，徐恩曾免职，叶秀峰继任局长。军统改组为保密局，先是由郑介民接替死去的戴笠人局长，后来郑出任国防部二厅厅长，转往军事情报系统，唐纵改任内政部政务次长兼警察总署署长，改搞警察工作，保密局局长由毛人凤继任。国民党逃台后，党通局改为内政部调查局，保密局改为国防部情报局。这两个机构至今仍存。
至于你说的奉系军阀和直系是北洋军阀中的派系，还有一个就是皖系。这3大系构成了北洋军阀的主体。其中只有以曹锟，吴佩孚，孙传芳为首的直系和以段祺瑞为首的皖系是袁世凯小站练兵时的嫡系。张作霖不属于北洋嫡系，是在东北以胡匪为基础发展起来的军阀集团，属于北洋旁系。奉系早期领袖为张作霖，主要军事骨干为张作相，吴俊升，张景惠，孙烈臣，汤玉麟，杨宇霆，重要文臣为王永江，臧世毅，鲍贵卿等。张作霖死后，其子张学良继位，奉系被国民党招安，改为东北边防军，改称东北军派系，也称新奉系，首领张学良，重要将领为万福麟，王以哲，王树常，何柱国，于学忠，刘多荃，鲍文樾，缪激流，容臻等。主要文臣有刘永清，莫德惠，高崇民，还有张学良的心腹，东北军特务系统首领黎天才和外交情报首脑阎宝航。
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