在弥生时代(弥生时代,弥生jidai,约公元前300年-公元300年),考古证据表明,有一个农民涌入(弥生人)日本从亚洲大陆。他们淹没了日本绳纹族当地以狩猎和采集为生的人口，并使之流离失所。现代日本人大多是弥生人的后代，只有很少的影响前绳纹狩猎采集者。
这一时期是以东京附近地区命名的，考古学家在那里首次发现了那个时代的手工艺品和特征。弥生时期的显著特征包括新的弥生陶器风格的出现和稻田集约化水稻农业的开始。一种等级森严的社会阶层结构可以追溯到这一时期，并起源于中国。弥生文化在从九州南部到本州北部的地理区域内繁荣。
在弥生时期，来自中国和韩国的文化特征在几个世纪的不同时期传入日本。中国的影响在青铜和铜武器、独教、独拓以及灌溉水稻的种植上很明显。弥生文化的三大标志是铜镜、青铜剑和御玺石。
弥生时代生活场景的例子
DNA证据表明弥生与长江三角洲有关
1996年至1999年间，日本国家自然科学博物馆(National Museum of Nature and Science)的研究员山口智(Satoshi Yamaguchi)领导的一个研究小组，将在日本山口县和福冈县发现的草生时代遗骸与中国沿海省份江苏省发现的遗骸进行了比较。研究小组发现弥生时代和江苏时代的遗迹有很多相似之处。DNA测试进一步证实弥生与中国长江地区有关。
DNA测试表明，日本首批种植水稻的农民可能是2000多年前从中国长江下游地区迁移过来的。在日本西南部发现的弥生时代的人类遗骸和在中国中部江苏省发现的汉代早期的人类遗骸之间发现了遗传相似性。人们认为，把灌溉技术引入日本群岛的人，要么来自对马海峡对面的朝鲜半岛，要么来自黄海对面的中国北部。
日本国立自然科学博物馆
传说中国第一个皇帝(秦始皇)派徐福(日本传说中的九福)和成千上万的男孩和女孩去寻找长生不老药。秦始皇想长生不老。据报道，徐志摩的团队今天抵达了日本三重县熊野地区。许仙决定留在神谷，不回秦国。据说徐带来的农耕技术和知识提高了古代日本人的生活质量。
15世纪时，日本圭书之主德川约立信(Tokugawa Yorinobu)在新谷(Shingu)立了一块墓碑来纪念徐志摩。1994年，新谷市在徐复的墓碑周围建造了一个纪念公园，并命名为Jofuku纪念公园。无论如何，徐志摩离开中国的时间大致与弥生文明在日本出现的时间一致。
日本新谷市的九福纪念公园
中国古代日本的记录
关于日本人最早的书面记录来自中国，大约在弥生时期。“Wo”是日本早期中文名字的发音，在公元57年被提到;南国收到了后汉光武帝的金印。公元5世纪范野编纂的《后汉书》记载了这一事件。这枚印章后来于18世纪在九州北部被发现。我们也提到了公元257年魏之(魏志),一段《三国演义》的记录臭名昭著编制的第三学者陈寿写。
1784年在日本福冈县石之岛发现的那王金印。
早期的中国历史学家将吴描述为一个由数百个分散的部落社区组成的土地，而不是像8世纪的著作《日本公社》(Nihon Shoki)中描述的那样，是一块统一了700年的土地。《日本公社》部分是虚构的，部分是对日本历史的记述，把这个国家的建国时间定在公元前660年。考古证据还表明，在这一时期，定居点或小城邦之间爆发了频繁的冲突。许多挖掘出来的定居点都有护城河或建在山顶上，这表明它们是为了保护而建的。在吉野礼遗址发现的无头人骨显示了暴力冲突，这被认为是这一时期的典型发现。
三世纪的中国资料也报道说，日本人以生鱼、蔬菜和盛在竹木托盘上的米饭为食，拍手做礼拜(今天的神道神社仍然这样做)，并建造土冢。
从遗传学上来讲，当今日本人有一定的中国人的基因，但不能证明日本人是中国人的后裔。