农业配套设施在一定条件下可占用基本农田。
根据国土资源部、农业部下发的《关于完善设施农用地管理有关问题的通知》（国土资发〔2010〕155号）中第二项第三条规定：
（三）引导设施建设合理选址。各地要依据农业发展规划和土地利用总体规划，在保护耕地、合理利用土地的前提下，积极引导设施农业和规模化粮食生产发展；
设施建设应尽量利用荒山荒坡、滩涂等未利用地和低效闲置的土地，不占或少占耕地。确需占用耕地的，应尽量占用劣质耕地，避免滥占优质耕地，同时通过耕作层土壤剥离利用等工程技术等措施，尽量减少对耕作层的破坏。
对于平原地区从事规模化粮食生产涉及的配套设施建设，选址确实难以安排在其他地类上、无法避开基本农田的，经县级国土资源部门会同农业部门组织论证，可占用基本农田。占用基本农田的，必须按数量相等、质量相当的原则和有关要求予以补划。各类畜禽养殖、水产养殖、工厂化作物栽培等设施建设禁止占用基本农田。
扩展资料：
1、农业基础设施建设一般包括：农田水利建设，农产品流通重点设施建设，商品粮棉生产基地、用材林生产基础和防护林建设，农业教育、科研、技术推广和气象基础设施等。
2、强化农业基础设施建设，是推动农村经济发展、促进农业和农村现代化的重要措施之一。改革开放30年来，我国农业基础设施建设取得了长足进展，农业生产条件得到不断改善。但是欠发达地区尤其是西部省份的农村，农业基础设施较为落后。
种植、养殖设施可占用基本农田。
2019年12月17日，《自然资源部 农业农村部关于设施农业用地管理有关问题的通知》（以下简称《通知》）明确规定：种植设施不破坏耕地耕作层的，可以使用永久基本农田，不需补划；破坏耕地耕作层，但由于位置关系难以避让永久基本农田的，允许使用永久基本农田但必须补划。养殖设施原则上不得使用永久基本农田，涉及少量永久基本农田确实难以避让的，允许使用但必须补划。
不过需注意的是，虽然自然资源部和农业农村部的《通知》对作物种植和畜禽水产养殖占用基本农田的口子有所放开，但种养殖占用基本农田的口子并没有完全放开，大家千万别会错了意。特别是搞养殖占用基本农田的要格外注意，按照《通知》要求，养殖设施占用基本农田有三个重要条件，一是“少量”，二是“难以避让”，三是使用需补划。
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