一、两者的位置不同：
1、垫层的位置：设于基层以下的结构层。
2、底基层的位置：设在面层以下的结构层。
二、两者的作用不同：
1、垫层的作用：其主要作用是隔水、排水、防冻以改善基层和土基的工作条件，其水稳定性要求较好。
2、底基层的作用：其设置的目的是防泥、防冰冻、减少路基顶面的压应力、缓和路基不均匀变形对面层的影响、防水、为面层施工提供方便、提高路面结构的承载能力和延长路面的使用寿命等。
三、两者的概述不同：
1、垫层的概述：垫层为介于基层与土基之间的结构层，在土基水稳状况不良时，用以改善土基的水稳状况，提高路面结构的水稳性和抗冻胀能力，并可扩散荷载,以减少土基变形。
2、底基层的概述：当基层分为多层时，其最下面的一层称底基层。在建筑中，基层是指面层下的构造层，包括填充层、隔离层、找平层、垫层和基土等。在沥青路面基层下，用质量较次材料铺筑的次要的承重层或在水泥混凝土路面基层下用质量较次材料铺筑的结构层称作底基层。
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