无毒无机物质主要指排入水体中的酸、碱及一般无机盐类。冶金、金属加工、化工、人造纤维、酸性造纸等工业废水，是水体酸性污染物质的主要来源；制碱、制革、炼油、化学纤维、碱法造纸等工业废水，是碱性污染物质的重要来源。酸性、碱性废水相互中和，或它们与地表物质相互作用，均可产生各种无机盐类，因而酸和碱的污染必然伴随着无机盐的污染。
有毒无机物质
有毒无机物质主要指重金属和氰化物、氟化物等。这类污染物具有强烈的生物毒性，在排入水体或进行农业灌溉后，会影响鱼类、水生生物、农作物的生长和生存，并可通过食物链危害人体健康。
无毒有机物质
无毒有机物指比较容易分解的碳水化合物、脂肪、蛋白质等。这些物质以悬浮或溶解状态存在于污水中，可通过微生物的生化作用而分解。由于在其分解过程中需要消耗氧，因而被称为需氧污染物。水生生物的生命活动、生活污水和工业废水中均有大量需氧污染物。
有毒有机物质
有毒有机物质种类很多，以酚类化合物、有机农药等最为常见。酚类化合物主要来自炼焦、炼油、煤气、制造酚及其化合物和用酚做原料的工业所排放的含酚废水；水体中有机农药主要是有机氯、有机磷农药和有机汞类农药，来源于农药工业废水及被水冲刷的用药土壤。随着石油工业及水上运输的发展，油类物质对水体的污染也越来越严重，大面积油污覆盖水面，影响水质及水域功能，破坏景观，危害水生生物，而且油类污染很难及时清除。
放射性物质
水体的放射性污染主要来源于核企业排放的含放射性污染物的废水，也包括固体放射性污染物淋洗进入地表径流，向水体投放的放射性废物，核试验降落到水体的散落物，以及核动力船舶事故泄露的核燃料。
生物污染物质
生物污染物质主要来自生活污水，医院、畜牧场、屠宰场污水、肉类加工、制革等工业废水，包括动物和人排泄的粪便中含有的致病细菌、霉菌、病毒、寄生虫以及某些进入水体的昆虫等。
水体热源污染
水体热源污染主要来源于工矿企业向江河排放的冷却水。其中以电力工业为主，其次是冶金、化工、石油、造纸、建材和机械等工业。