治疗化脓性颌骨骨髓炎的手段主要包括药物治疗和手术疗法。对于急性颌骨骨髓炎，关键在于控制炎症，这需要根据临床表现、细菌培养结果以及药物敏感性测试来选择合适的抗生素进行足量、有效的治疗。
对于慢性颌骨骨髓炎，手术是首要选择，药物如抗生素则作为手术前后辅助手段。急性炎症时，若发现骨髓腔内有化脓病灶，应迅速拔除病灶牙和邻近的松动牙，以便脓液排出。如果炎症突破骨板形成脓肿或间隙感染，手术切开引流是必不可少的。
慢性颌骨骨髓炎的手术目标在于移除死骨和病灶。手术条件包括：药物治疗无效、长期存在的瘘管、反复发作的炎症，以及X线显示的骨质破坏。一般建议在发病3-6周后进行手术，因为此时死骨与周围组织已分离，便于确定手术范围。手术过程中，死骨会被清除，同时炎症的牙胚、病原牙和松动牙也会一并摘除，以防止炎症的复发。手术后还需刮除炎性肉芽组织，以确保彻底清除病变。
由细菌感染以及物理或化学因素，使颌骨产生的炎性病变，称为颌骨骨髓炎。累及范围包括骨膜，骨密质、骨髓以及骨髓腔内的血管、神经等整个骨组织成分。根据临床病理特点和致病因素不同，分为化脓性颌骨骨髓炎，婴幼儿骨髓炎，以及由物理、化学因素引起颌骨坏死继发感染的骨髓炎，因结核杆菌、梅毒螺旋体、放线菌等感染引起的特异性颌骨骨髓炎等。化脓性颌骨骨髓炎占各型颌骨骨髓炎的90%以上。