清洁是通过建立5S管理制度体系来巩固前面3S的成果。
清洁就是将“整理、整顿、清扫”阶段的做法制度化、标准化，通过建立5S管理制度体系来维持、巩固、深化前面3S的成果。整理、整顿、清扫是动作，达到的状态是清洁，同时必须通过清洁来巩固取得的成果。要保持清洁就要不断地进行整理、整顿、清扫，因此“清洁”需要在前面3S的基础上维持、巩固、深化。
清洁时的注意事项有哪些
1、加强宣传以保持全员3S意识
清洁既然是以3S为基础，所以做一些宣传工作，以维持员工的3S意识是首要的工作。可以通过教育培训、观摩3S实施中优秀的标杆单位、举办一些活动发布3S成果相互交流经验，利用内刊、5S简报、宣传画、标语等形式来加强员工的意识。
2、切忌将清洁理解为卫生问题，用于应付评比检查
许多企业管理者将整洁、清爽认为仅仅是卫生问题，与生产关系不大。持这种观点之后，做起清洁来自然会把它摆在与生产不相干的次要地位。或者当有上级领导来检查工作时临时做一次全面的大扫除，做给别人看。而日本企业管理者认为5S是现场管理的基石，5S做不好的企业不可能成为优秀的企业，因此它们将坚持5S管理作为重要的经营原则。
3、清洁的对象不能只考虑现场的材料和设备方面
工作环境不仅要整齐，而且要符合卫生要求，防止职业病的发生，保证员工身心健康。不仅要考虑现场的材料和设备的清洁，而且要考虑整个工作环境的清洁，清除粉尘、噪声、有害气体，保持空气新鲜。
保持形体整洁，员工统一着装，不仅可以展现公司的好形象，而且能够培养员工的集体观念和团队精神。保持精神“清洁”，员工遵守职业道德，语言“清洁礼貌待人，不仅可以体现个人涵养，而且能够展示企业文化。
4、检查必须长期坚持，通过反复检查来固化提升5S
5S如果只是短期检查，是没有任何意义的。因为短期检查完毕之后，很快又会恢复原状。一旦恢复原状，就需要重新花费大量的人力、物力、时间，从头开始。因此，如果希望现场能够长期保持良好状态，就需要每个月定期检查5S的固化程度，“在出现倒退苗头的时时候及时控制”，这是非常重要的。
不能总是以忙碌为借口而一拖再拖，必须扎实实地把5S活动持续下去。必须认识到整理的必要性、整顿的关键性以及清扫的重要性。