没有区别的。形式不同利于吸收不同的人才。
考试时间和科目有点不同。
自主招生属於全国统考的一部分。自主招生是扩大高校自主权、深化高校招生录取制度改革的重要举措，也是对选拔优秀创新人才的新探索。入选考生均须参加全国统考，成绩达到生源所在省（自治区、直辖市）确定的与试点学校同批次录取控制分数线的，省级招办应向考生选报的试点学校投档；试点学校进行综合评价、自主选拔录取。
自主招生属於国家计划招生，自主招生名额原则上不超过总计划的5%。且国家严格审查参加自主招生院校资格，必须由国家教育部批准方可采取自主招生。
一般开始自主招生的院校都会发布自主招生专业以及自主考试时间，通常在当年的11月-12月左右。
如果是属於国家统一招生的文凭，比如3本，2专，和公办文凭一样。
如果不属於国家统招，那就不一样了，通常社会上大部分单位是不承认自考和其他非统招学历的。
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