图书馆76%的馆藏文献实行了开架借阅，图书馆年接待读者85万人次以上，读者日流量近4000人次。图书馆馆藏纸本文献已达125万余册（件）和电子文献2个G，档案馆收集有全校各类档案12类2.3万余卷。馆藏纸本文献中，汉文图书60余万册，外文图书20余万册，蒙文图书6万余册，中外文报刊合订本23万余册，线装古籍11万余册。馆藏文献具有鲜明的民族特点和地区特色，以蒙古学和生命科学为收藏重点，国家教育部民族学科“蒙古学文献信息中心”，是直属国家教育部的全国十六所文科文献信息中心之一，是内蒙古自治区和国内蒙古学研究的重要文献基地，藏有各文种、各类型蒙古学文献3万余册（件），其中蒙古学古籍清代朱字木刻本《御制蒙古文甘珠尔经》、托忒蒙古文清代竹笔手抄本《西游记》、1721年巴黎版《贴木尔武工记》、剌失丁著《史集》1836年巴黎法文版等系蒙古学文献的稀世珍品。“内蒙古自治区高等学校外文文献中心”由自治区教育厅专款扶持，面向全区27所普通高等院校提供外文原版文献服务。“内蒙古大学生命科学文献信息中心”以生态学与农牧业生物工程学科为特色，重点开发生态学、动物生殖生物学及生物技术、微生物学与基因工程等学科的国内外文献资源。《四库全书》系列文献亦颇丰富，有台湾文渊阁版《四库全书》、台湾版《四库全书荟要》、《四库全书存目丛书》等重要文献及其相关文献。
为了充分发挥内蒙古大学图书馆在自治区中心馆的作用，由内蒙古大学图书馆馆长阿拉坦仓博士提出，经内蒙古自治区教育厅的批准，内蒙古高等教育文献保障系统（NALIS）形成。其主要任务是：通过内蒙古大学信息服务网络和文献信息资源的数字化建设，在CALIS中心建设经费资助下，加快地区文献服务中心的建设步伐，初步实现系统内的公共检索、馆际互借、文献传递、协调采购、联机合作编目等功能，建成内蒙古高等教育文献保障服务体系的基本框架，并全方位向自治区内各高校及社会提供信息保障服务工作。该中心的网站已在图书馆的网站上开通。作为学校的文献信息中心和为教学科研服务的学术性机构，图书馆在近5年内圆满完成了《中国蒙古文古籍总目》等文献研究科研成果13项，正在进行中的“蒙古文文献计算机管理集成系统”和“蒙古文图书书目数据库光盘”开发项目等有12项，超过了前40年的总和，其中《中国蒙古文古籍总目》1997年被定为国际图联IFLA促进发展中国家图书馆事业核心计划项目，2000年获自治区社会科学优秀成果一等奖。
