原版就有指令能够大规模删除方块，如/fill填充指令，只需要将填充方块改为空气就能删除方块。具体用法：填充区域为一个长方体，作一体对角线。记对角线连接的两顶点坐标为（XYZ1）与（XYZ2）然后输入指令/fill （XYZ1） （XYZ2） air。执行指令后就能清除这个长方体内所有除空气外的方块。
为防止游戏卡顿，这条指令划定的区域内方块数最大只有三万多。如果区域过大会报错。可以执行多次这个指令将多个区域拼接起来。
也可以使用mod来大规模删除方块，不过不建议这样做。大规模的替换方块会导致游戏卡顿甚至游戏崩溃和存档损坏。
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