哈哈，这个问题有意思了，秽土转生的四代火影厉害还是三代火影厉害？个人认为二人在秽土转生状态下应该是五五开的情况，下面具体说明一下。
秽土转生状态下双方的优势技能基本上发挥不出最佳效果。
既然是秽土转生状态的四代火影和三代火影，除了掌握六道级别的实力否则普通的输出手段对于秽土转生个体基本上是没有杀伤效果的，也就是说无论是波风水门的飞雷神还是猿飞日斩的的五属性忍术技能都不能有效的杀伤对方。
波风水门的速度再快即使击中猿飞日斩过一段时间猿飞日斩又复原了，同理猿飞日斩的优势多属性忍术攻击可能根本打不中波风水门，即使打到了水门照样可以恢复。至于二人生前都会的强力封印术尸鬼封尽估计不可能在秽土转生状态下使用（否则剧情里边可以利用这招对付宇智波斑或者带土了）。
因此双方都处于谁也奈何不了谁的情况下，即使秽土转生状态的波风水门能够使用九尾的力量同时还能够使用仙人模式，对于秽土转生状态的猿飞日斩作用不大。
二人掌握的常规攻击模式对于秽土转生状态者作用有限，因此双方在没有其它外力介入的情况下应该是五五开，谁也奈何不了谁。
如果面对能够使用求道玉同时具备六道之力的角色，波风水门的速度优势明显，持久战能力超过猿飞日斩。
剧情中只有具备六道之力的角色能够对秽土转生个体造成有效杀伤，被攻击的角色无法在快速复原。因此这种情况下波风水门的飞雷神在保命方面的效果就比猿飞日斩好太多了，即使打不过波风水门想要逃跑还是做得到的，但是秽土转生猿飞日斩想要面对六道级别的攻击跑路基本上是不可能的，虽然老头子瞬身术速度不慢，但是绝对速度还是比不过波风水门。
因此如果评价二人对战六道级别的对手情况，波风水门的情况会好一些，虽然波风水门缺乏中远距离的输出手段，评价飞雷神还可以和六道级别的敌人周旋一下，三代火影虽然基础正面输出能力强于波风水门，被六道级别得敌人盯上也没有多少好下场，魂飞魄散可能就是最终结局了。
最后总结一下，个人认为秽土转生状态的波风水门和猿飞日斩二人互相攻击的话实力应该是五五开，毕竟秽土转生的特点把水门飞雷神和三代火影忍术技能的优势都降低了不少。分析不到位地方请见谅，各位有其他想法欢迎留言讨论。