法律分析：1、主体不同.协议拆迁往往是民事主体，征地拆迁一般是政府的征收部门。2、目的不同。协议拆迁，往往是为了商业利益，征地拆迁中拆迁协议的签订一般是为了公共利益的需要。3、违约责任不同。协议拆迁中，双方若不履行协议，往往承担民事责任；而征地拆迁中，往往涉及到行政责任，比如国家赔偿。
法律依据：《中华人民共和国城市房地产管理法》 第六条 为了公共利益的需要，国家可以征收国有土地上单位和个人的房屋，并依法给予拆迁补偿，维护被征收人的合法权益；征收个人住宅的，还应当保障被征收人的居住条件。具体办法由国务院规定。