学校组织机构的结构类型主要包括直线型、职能型、直线--职能型、矩阵型等。
1.直线型：
直线型结构是最早，也是最简单的一种学校组织结构类型。直线型结构的特点是组织中的职务按垂直系统直线排列，组织中每个人只向一个直接上级报告。
2.职能型：
职能式组织结构是在直线式结构的基础上发展起来的。由于管理事务的日益复杂，用直线式结构进行管理，便会出现管理者力不从心的问题。于是，职能型组织机构模式是组织内除直线主管外还相应设立一些组织机构，分担某些职能管理的业务。按专业分工设置管理职能部门，各部门在其业务范围内有权向下级发布命令与指示，下级既要服从上级主管的指挥，又要听从上级职能部门的指挥。
职能式结构具有分职、专责的特点。其优点在于有利于发挥管理人员的特长，提高他们的专业能力。其缺点是：多头领导，削弱了必要的集中统一，管理人员过多，有时影响工作效率。
3.直线一职能型：
直线职能式组织结构是将直线式和职能式结构相结合而产生的一种组织结构。这种组织结构有两个显著的特点：一是按照组织的任务和管理职能划分部门，设立机构，实行专业分工，加强专业管理;二是这类结构将管理部门和管理人员。
直线职能式结构抛弃了职能式结构多头领导，指挥不一的缺点，保留了职能式结构管理分工和专业化的优点，又吸收了直线式结构集中统一指挥的优点，因而管理系统完善，隶属关系分明，权责清楚，故是比较好的组织结构形式。在现代社会，它有着较广的适应范围。
4.矩阵型：
矩阵式组织结构就是由纵横两种管理系列组合而成的方形结构。一种是纵向的职能部门结构;一种是横向的项目管理结构。二者交叉重叠，便组成矩阵式组织结构。
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