村里修路占农田不合法。
农民对自己的责任田享有土地承包经营权，土地承包经营权属于物权的范畴，具有排他的效力，有权拒绝被占用。而且修建公路根据公路级别的不同必须要经过相关部门批准，任何单位个人未经批准，不得私自修建公路。如果同意占用，可以参照土地被征收标准得到土地补偿费、安置补助费、地上附着物补偿费。
申请农村修建道路流程：
1、提交申请书由交管站审核。
2、上报到当地县农村公路建设办公室。
3、当地县人民政府审核。
4、工作人员考察通过后开工。项目下达后，各村进行开工准备工作，就绪后向交管站申请，由交管站工作人员检查路基完成情况。
5、如果路线情况符合要求后，由项目村携带开工报告（开工报告须经乡镇、交管站、村委会签字盖章）、施工合同复印件、公章、收据到县农村公路建设办公室办理监管合同和其它手续（包括资料盖章、签订合同、领材料等）后，才可开工。
综上所述，在相关前期工作完成后，县级以上地方人民政府方可申请征收土地，这样在农田上修路才不违法。
【法律依据】：
《中华人民共和国土地承包法》第四十条
土地经营权流转，当事人双方应当签订书面流转合同。
土地经营权流转合同一般包括以下条款：
（一）双方当事人的姓名、住所；
（二）流转土地的名称、坐落、面积、质量等级；
（三）流转期限和起止日期；
（四）流转土地的用途；
（五）双方当事人的权利和义务；
（六）流转价款及支付方式；
（七）土地被依法征收、征用、占用时有关补偿费的归属；
（八）违约责任。
承包方将土地交由他人代耕不超过一年的，可以不签订书面合同。
《中华人民共和国民法典》 第二百四十四条
国家对耕地实行特殊保护，严格限制农用地转为建设用地，控制建设用地总量。不得违反法律规定的权限和程序征收集体所有的土地。
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