兔常用消毒药有烧碱（氢氧化钠）、草木灰水、石灰乳、来苏儿、漂白粉、新洁尔灭、福尔马林、过氧乙酸、菌毒敌、百毒杀、消毒灵和酒精、碘酒、高锰酸钾等。
（1）烧碱（氢氧化钠）
对细菌、病毒，甚至寄生虫卵，均有强大的杀灭作用。含94%氢氧化钠的粗制品，杀菌作用强。2%～4%的低浓度，对一般细菌和病毒易杀灭；20%高浓度的氢氧化钠对芽胞杆菌、部分虫卵有杀灭作用。一般笼舍和笼底板、产仔箱等设备的消毒宜用低浓度。为控制疫情的强制性消毒，对墙、地面、耐碱的笼具和运输器具采用高浓度为宜。烧碱液的配制，若用温水可显著增强其杀菌力。凡采用烧碱水消毒，事先应清除污物，消毒后，必须用水冲掉碱水。
（2）草木灰水浸液
草木灰内含有氢氧化钾、碳酸钾。在50千克水中加入15千克新鲜草木灰煮沸1小时，经过滤后喷洒兔舍和地面，可代替烧碱的作用。但须现配现用。
（3）生石灰（氧化钙）
灰白色、块状，加水生成氢氧化钙，有良好的杀菌作用。一般用10%～20%石灰乳，涂刷兔舍的五面板壁、地面，或直接用生石灰粉撒于粪池、污水周期、阴湿地面。用石灰乳要现配现用，因它能吸收空气中的二氧化碳变成碳酸钙而失效。
（4）来苏儿（煤酚皂）溶液
含50%煤酚，红棕色浓稠液体，易溶于水和酒精。能使菌体蛋白变性、沉淀，而具杀菌能力。主要用于洗手、器械和喷洒场地、笼舍消毒。起防腐、止酵的作用。一般用2%～3%浓度。
（5）漂白粉（含氯石灰）
灰白色粉末，有氯臭味，微溶于水，含有效氯25%～30%（低于16%不用）。久存易分解失效，须置密闭干燥处保存。杀菌作用快而强，还有除臭作用，对芽胞有杀灭作用。常用浓度5%～20%，主要用于笼舍、排泄物的消毒。不宜用于有色纺织物和金属用具。
（6）新洁尔灭（溴化苄烷铵）
对革兰氏阳性细菌和阴性细菌有杀灭作用。但对病毒、芽胞、结核杆菌、绿脓杆菌没有杀灭作用。易溶于水，性质稳定，对皮肤、黏膜等组织刺激性小，穿透力强，并有脱脂，去污功效。常用于家兔皮肤消毒（0.1%），黏膜消毒（0.01%～0.05%），器械、器皿消毒（0.1%，30分钟）。若用于金属器械消毒需加0.5%亚硝酸钠防腐。禁止与肥皂、碘剂、盐类、碱、高锰酸钾等配用，以免失效。
（7）福尔马林（甲醛）
市销产品一般含40%的甲醛。主要用于家兔笼舍熏蒸消毒。每立方米空间用20毫升福尔马林加等量水，加热密闭熏蒸10小时。用5%～10%的福尔马林溶液，可作粪尿沟等环境的消毒。使用时须注意：熏蒸前应将兔子和饲料转移，消毒完须先打开门窗通风换气，无药味后方可转回兔子和饲料。
（8）过氧乙酸
是一种高效杀菌剂，无色透明的液体，市售品浓度多为20%，密闭避光保存于塑料瓶中。以用0.1%～0.5%的溶液喷洒兔舍地面、走道、墙壁、门窗、兔笼、车辆等。3%～5%溶液常用来加热熏蒸，做环境消毒。
过氧乙酸不稳定，一般有效期为半年。消毒时宜现配现用。另外应对消毒人员的眼睛、呼吸道加以保护，兔子也应转移。
（9）菌毒敌（复合酚）
是一种广谱、高效、低毒对人畜无腐蚀性的新杀菌药。一般商用菌毒敌为0.5%的水溶液。主要用于笼舍及附属设备和用具的消毒。
（10）百毒杀
是高效、广谱杀菌剂。市售产品为0.02%的水溶液。主要用于笼舍、用具和环境消毒。使用时详见产品说明书。
（11）消毒灵
本品对人畜无害，无刺激和腐蚀性，易于贮运，使用方便。对细菌和病毒有高效杀灭作用。可广泛用于家兔体表、圈舍、饲槽和运输器具的消毒。
（12）酒精（乙醇）
无色易燃，易挥发的液体。酒精能使蛋白质变性，从而具有较强的抑菌和杀菌作用，是一种最常用的皮肤消毒药。能杀死一般细菌，对芽胞菌无效。有蛋白质存在时，杀菌力减弱，95%浓度的渗透力反而比70%～75%浓度的渗透力低，消毒效果较差。但可用于酒精灯作火焰消毒。70%～75%的酒精是给兔子打针时作皮肤消毒和注射针头及体温表最常用的消毒药，养兔场必备。
怎样把95%的酒精配成家兔消毒用的70%～75%的酒精溶液呢？举例如下：
欲配70%酒精100毫升，应取95%酒清多少毫升？
70%×100＝95%×m>（95%酒精毫升数）
即取95%酒精73.7毫升加水至100毫升即可。
（13）碘酒（碘酊）
为最常用的皮肤消毒药之一。能氧化病原体原浆蛋白的活性基团，并与蛋白质的氨基结合而使其变性，有强大的杀灭病原体（细菌、病毒、芽胞、真菌、原虫）的作用，并具有一定的止血作用。兔用碘酊一般为2%，可取碘化钾1克溶于少量蒸馏水中，再加碘片2克与适量的70%～75%酒精，搅拌使其溶解，再加70%～75%酒精至100毫升即得。
（14）高锰酸钾（锰强灰）
深紫色结晶，易溶于水，无臭。是一种强氧化剂，久置还原为棕色而失效，故须新鲜配制，有杀菌、除臭作用。常用于冲洗黏膜腔道、创伤和化脓腔洗涤，作用比过氧化氢持久。