办公室主任的主要职能就服务，为领导的科学决策和决策的正确执行服务。服从具体的讲，其基本职能大体有四项，即参谋职能、承办职能、管理职能和协调职能。 参谋职能，承办职能，管理职能，协调职能。
办公室主任要全面履行其协调职责，要着力做好纵向协调、横向协调、内部协调等多方面的工作。纵向协调，即致力于上下级之间关系沟通，上令下行，下情上达，上下紧密配合，步调一致的协调工作。
办公室主任在这方面的职责主要体现在:当上级的决定、决议、指示、命令形成后要尽快向下传达，使之得以认真贯彻执行，以保证政令畅通，上令下行。
当下级对上级的某一决定、指示不理解或不完全理解时，要以认真负责的精神去做解释说服工作;当下级对上级的指示、决定、命令有不同意见时，要及时、准确地予以反映，使下情得以上达，以利于上下沟通，步调一致;当下级某一单位某项工作领先时，应积极组织力量去调研，认真总结经验，及时予以推广以点带面。
当下级某一单位某项工作处于落后状态时，要积极主动地协助领导进行重点帮助，"以面促点"，"以面带点"，使之尽快迎头赶上;横向协调，即致力于"左邻右舍"、同级各业务部门之间关系的协调。业务部门的一些部门性文件、规定。
一般均须先报送办公室主任修改、审阅，进行协调，以免对同一事项的规定不尽吻合，使下级难以适从;业务部门的一些重要工作安排，如召开请领导参加的会议、开展由领导同志"挂帅"的突击性、临时性工作任务等。
一般也须经办公室主任统一协调，以避免部门之间"撞车"和领导"超负荷"现象的发生;当各业务部门、各单位因认识和处理问题的角度不同引起矛盾时，办公室主任更应充分发挥其协调职责，对过去已有明文规定的事项，要维护政策的严肃性，督促有关方面或协助领导督促有关方面加以认真贯彻落实;对过去尚无明文规定的。
要在认真 听取各方意见的基础上，处理好各有关政策精神的衔接，并向领导提出解决的意见和建议，协助领导作出裁决，把各方的意见统一到总政策上来;内部协调，即以办公室内部的人员、工作为对象，使其和谐、协调地开展工作。
办公室主任要着力于室领导成员和室内各单位(处、 室、科、组)之间关系的协调。在室领导班子内，要注意发挥副职的作用，要按照合理分工、分层次管理的原则，根据其特长，让副职负责某方面或几方面的工作，以充分发挥领导班子的整体效能。