红豆杉树形优美，种子成熟时呈鲜红色，似颗颗红豆缀于绿叶之中，十分美丽，最宜作园景树，可孤植、丛植于公园、风景区、植物园之园区一隅、路径之侧、庭榭之旁、山石之间、池边塘际，或与其他针阔叶树混植成林，都有好的绿化及观赏效果，也可植于园林小区、休闲广场绿地草坪之中、喷泉周围、房前屋后、庭院之中。同时，也可制作盆景观赏。红豆杉全身是宝。树皮、根、叶可提取抗癌新药紫杉醇。
种子可榨油，用于制皂和油漆润滑油。木材结构细密，耐水湿，边材黄褐色，心材橘红色，是现代红木家具和雕刻的优良用材，同时还可以浸取红色染料。