来自葡萄牙、比利时、美国的三个研究小组分别公布在全球多地暴发的猴痘（Monkeypox）疫情中感染者所携带病毒基因组序列的初步结果。
猴痘病毒最新基因测序结果公布，哪些信息值得关注
感染猴痘的人通常在感染后7到14天开始出现症状，病情通常会持续几个星期。世界卫生组织和美国疾病控制与预防中心都宣称，“尽管大多数人能从病毒中康复，但在某些情况下，它可能是危险的，甚至可以致命。”
葡萄牙国家卫生研究所的约翰.保罗.戈麦斯（Jo o Paulo Gomes）及其同事在（https://virological.org）网站上，以论文形式公布了团队5月4日对一名葡萄牙男性患者携带的猴痘病毒的基因组测序草案（PT0001）。这也是近期全球多地暴发猴痘疫情以来，第一份猴痘病毒最新基因组的测序结果。
团队用QIAamp DNA血液试剂盒(Qiagen)从患者皮肤渗出样品中提取出猴痘病毒的DNA，使用快速条形码测序试剂盒(SQK-RBK004)，在Oxford Nanopore MinION平台上对病毒基因组进行了鸟枪法宏基因组测序。整个基因组的平均覆盖深度约为7倍。（覆盖深度，亦称测序深度，指每个碱基被测序的平均次数，即测序的数据总量与基因组大小的比值）随后，团队利用INSaFLU在线平台，将多个短基因片段（reads）映射到一个相关的参考基因组序列上(MN648051.1)，并手动检查基因组序列以验证变异位置。公布的基因组草图序列覆盖了92%的参考序列。
葡萄牙团队公布的基因进化树分析草案基于对包括52个猴痘病毒基因序列的核心比对（在137 668 bp长度的基因序列中比对了955个变异位置）根据这篇论文，基因进化树分析草案显示，分离出来的病毒与2018年和2019年从尼日利亚传播到英国、以色列和新加坡的病毒有密切关系。论文作者表示，一旦获得高深度的Illumina数据（测序还在进行中），病毒基因组序列将被进一步呈现。
现在已经得到充分研究的新冠病毒，也很难将特定的突变与病毒传播能力等方面的变化联系起来。猴痘病毒有一个庞大的基因组——大约有20万个碱基对，而冠状病毒只有3万个碱基对——目前科学家们并没有那么深入的研究。