首先你明确一个概念：晋朝之前只有一个汉朝，一个宗庙。明白了这个概念就清楚了西汉、东汉和蜀汉的关系了。
《前汉书》明确记载：“世祖即位，然后宗庙社稷复立”。世祖即东汉光武帝刘秀。
刘秀，乃是汉高祖刘邦的九世孙，汉景帝七世孙，长沙定王之后刘发之后。不同于刘备，刘秀是有明确族谱传承的。
刘秀父亲刘钦曾任县令，可惜在刘秀九岁那年去世了。家道中落，刘秀的成长之路坎坷不平。
也许他真的是修正历史的位面之子，凭借一系列神操作，面对断壁残垣、江山破碎的社会状况，刘秀重整山河，挽狂澜于既倒，扶大厦之将倾，重立汉家宗庙。
这里面有一个问题，以刘秀的身份是不能登基为帝的。刘秀虽然是汉景帝之后，可到了他这一辈已经和西汉宗室出了五服了，属于旁支的旁支，一直旁支出去好几里地。了解五服概念的人知道，出了五服就不算一家人了，就是诛九族都轮不到你了。
刘秀打的旗号一直是中兴汉室，但天下实际是自己打下来的。按照礼仪，刘秀登基应该追封自己祖上四辈为帝，建立宗庙。这里面就冲突了：汉已有宗庙，你刘秀又要中兴汉室宗庙，然后还要立自己家的宗庙，你家和汉皇室已经不是一家了，一个国家怎么可能有两个宗庙？
皇帝都坐了，这么点事还能难住吗？刘秀充分发扬民主，集思广益，下面的大臣也终于想出了一个两全其美的办法：过继。
历史上过继的皇帝不少，最有名的莫过于光绪和溥仪了。过继之后，你就不属于以前的家庭了，过继后的父母才是你家谱上的父母，可以继承其财产。
刘秀过继给了汉元帝刘奭（音是），这样就解决了刘秀身份的问题。对于祭祀宗庙，大臣们也是发扬涸思干虑的精神，为刘秀考虑周全了。对于刘秀祖上血亲，立宗庙由大臣祭祀；国家宗庙，汉元帝以上，由刘秀祭祀，汉元帝以下，都是刘秀平辈或晚辈，由主管单位祭祀。
也许有的人会说了：反正就一个牌位，都放一起就完事了。想可以这么想，但对于宗法礼仪大过天的封建社会来说，这是不可能发生的事，尤其讲究血统的皇室。历史上曾经发生过类似事情，就是明朝嘉靖帝和群臣的大礼仪之争，有兴趣的可以找找这方面资料。
对于大耳贼刘皇叔，这事就有点复杂了。
东晋习凿齿著《汉晋春秋》中记载：“玄德，汉高之正胄也，信义著于当年，将使汉室亡而更立，宗庙绝而复继。”
《三国志》记载刘备称帝“置百官，立宗庙，袷祭高皇帝以下 ”。
史书都记载了刘备重立汉室宗庙。可是刘备的身份却是有疑议的。
裴松之在《三国志注》里说：“先主虽云出自孝景，而世数悠远，昭穆难明，既绍汉祚，不知以何帝为元祖以立亲庙。于时英贤作辅，儒生在宫，宗庙制度，必有宪章，而载记阙略，良可恨哉！”
也就是说，你自己说是孝景帝玄孙，可是没有证据啊。
这个今天先不讨论，总之刘备也立庙祭祀了，至于是不是他家的，反正是汉朝皇室享用祭祀了。