法律分析：土地被侵占的诉讼时效应为三年，并自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。如果法律另有规定的，依照其规定。但是，如果自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护。土地被侵占的，可以直接要求侵占人返还非法侵占的土地；如果侵占人拒不返还，可以到法院起诉追回；公民的个人财产，包括公民的合法收入、房屋、储蓄、生活用品、图书资料、林木、牲畜和法律允许公民所有的生产资料以及其他合法财产；公民的合法财产受法律保护，禁止任何组织或者个人侵占、哄抢、破坏或者非法查封、扣押、冻结、没收。
土地使用权纠纷起诉办法如下：1、准备好民事诉讼状。2、到具有管辖权的人民法院起诉，并提交相关的证据材料。3、按照人民法院的通知准时出席参与诉讼活动。4、若不服一审判决或裁定，应在接到判决书后15天内或接到裁定书后10天内向原审人民法院或上一级人民法院提出上诉，并递交上诉状。
法律依据：《中华人民共和国民法典》 第一百八十八条 向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。