1、性质不同：农村信用社是一个合作组织，全名为农村信用合作社，属于非银行金融机构。而村镇银行则属于银行金融机构。
2、持股人及股权结构不同：农村信用社是社员入股，股东一般为个人，人数比较多，股权比较分散。而村镇银行需要有一家商业银行作为主要发起人，其股东可以是境内外的金融机构、境内的非金融机构和个人。相比之下，村镇银行的股权结构更集中一些。
3、发展方向不同：农村信用社的发展方向主要是纵向发展，即升级成为农村商业银行，摆脱非银行金融机构的帽子。所以，农村信用社的数量是在不断减少的。而村镇银行的发展方向主要是横向发展，即不断扩充银行的数量。所以，村镇银行的数量是在不断增加的。
当然，二者在发展过程中可能也会存在交集。因为农村信用社在升级为农村商业银行后，便可以发起成立村镇银行了。所以，有些村镇银行可能就是由农村信用社升级后发起成立的。
以上内容参考 百度百科-农村信用社
两者没有区别：
农村信用社与村镇银行同属一个系统，由农村信用社联合会管理。
信用社是农业银行和村镇银行的前身。当信用社资产规模达到一定标准后，可以重组为农业银行和商业银行。对客户而言，信用社和村镇银行本质上是以社区为基础，服务于当地人民银行的地方性金融机构。
农村商业银行和农村商业银行是指农村信用社。农业商业银行（原农村信用社）是我国金融体系的重要组成部分，是合作金融组织的主要形式。
中国农业商业银行是一家独立的法人实体。依法对农村信用社的债务负全部责任，享有民事权利，承担民事责任。推进农村信用社向现代企业转型，发挥信用社支农主力军作用，是中国金融工作会议作出的重要部署，也是深化改革的重中之重指地方金融机构。
扩展资料：
农商银行的机构特点：
1、农民和农村的其他个人集资联合组成，以互助为主要宗旨的合作金融组织，其业务经营是在民主选举基础上由社员指定人员管理经营，并对社员负责。其最高权利机构是社员代表大会，负责具体事务的管理和业务经营的执行机构是理事会。
2、主要资金来源是合作社成员缴纳的股金、留存的公积金和吸收的存款；贷款主要用于解决其成员的资金需求。起初主要发放短期生产生活贷款和消费贷款，后随着经济发展，渐渐扩宽放款渠道，和商业银行贷款没有区别。
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