农业综合行政执法机构，主要就是针对农业农村以及农民出现不合理现象进行教育以及处罚，分为两个部分。第一个，农业行政执法部门，主要负责组织、领导、协调全县农业的综合执法，依法展开农作物种子、种苗和投入，保证农产品的质量安全。除此之外，还负责农业资源与农业环境的保护、农业植物检验检疫、农业野生植物保护、菜地开发基金征缴、农业知识产权保护以及农村土地承包经营等方面的活动，如果出现农业违法案件的话，也会予以查处。第二个，农业行政执法大队，主要就是对违法违规行为实施处罚，如果农民之间的劳务与费用出现纠纷的话，也会进行调查，并且实施处罚，保护农产品无污染。
法律依据：
《农业行政处罚程序规定》 第二十六条 当场作出行政处罚决定时，农业行政执法人员应当遵守下列程序：
（一）向当事人表明身份，出示行政执法证件；
（二）当场查清当事人的违法事实，收集和保存相关证据；
（三）在行政处罚决定作出前，应当告知当事人拟作出决定的内容及事实、理由、依据，并告知当事人有权进行陈述和申辩；
（四）听取当事人陈述、申辩，并记入笔录；
（五）填写预定格式、编有号码、盖有农业行政处罚机关印章的当场处罚决定书，由执法人员签名或者盖章，当场交付当事人；当事人拒绝签收的，应当在行政处罚决定书上注明。
前款规定的行政处罚决定书应当载明当事人的违法行为，行政处罚的种类和依据、罚款数额、时间、地点，申请行政复议、提起行政诉讼的途径和期限以及行政机关名称。
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