(一)原料
化妆品是由各种原料经过合理调配加工而成的复配混合物，原料种类繁多，性能各异，有油质原料、粉质原料、胶质原料、表面活性剂、溶剂原料、香精香料、染料、颜料等，在这些原材料中，天然的动植物成份及其提取物如明胶和骨胶原多肽水解物、胎盘提取液、水貂油、羊毛脂、人参、当归、芦荟及其提取液等，极易受到微生物的污染，其次被微生物污染可能性大的原料还有增稠剂、粉体、表面活性剂稀溶液等，相对而言，油脂、高级脂肪酸、醇类、香料、酸、碱等原料被微生物污染的可能性较小。
(二)水
水在整个化妆品生产过程中所占的地位极其重要，一般化妆品配方中水的比例大约为30%～70%，工艺生产中水的用量更大。普通的生活饮用水中含有一定量的Ca2+、Mg2+、Fe3+、Mn2+、Na+等离子以及有机物和微生物，不宜用于制造化妆品。随着科学技术的飞跃发展，各种水质纯化技术推陈出新，微滤(MF)、超滤(UF)、纳滤(NF)、离子交换、反渗透(RO)、电渗析(ED)等技术的单独或组合应用，可以得到符合化妆品配制及生产用水要求的纯水或超纯水。
必须指出，经过离子交换或反渗透等方法处理的纯水或超纯水中，仍有一定数量的微生物存在，必须对其进行消毒杀菌处理，常用的方法有紫外线消毒、臭氧杀菌、煮沸灭菌、化学消毒剂消毒等。
(三)管道与设备
化妆品生产设备包括乳化罐、贮罐、管道、阀门、接头、流量计、过滤器、泵和灌装机等，大多数化妆品生产企业产品种类繁多，设备为多种产品共用，如果采用通用的化工生产设备，在设计时没有从清洁卫生方面考虑，拆卸较麻烦，难以完全清洗消毒，设备和管道上滋生了微生物，产品流经时会不断被污染。
(四)包装物
化妆品的内容物因容器和附件而污染微生物的情况是屡见不鲜的，容器生产厂家的卫生环境未必能保证容器在生产、贮存和运输过程中的清洁卫生，故包装容器在使用前应按以下程序进行清洁和消毒处理：①用清水冲洗一遍;②消毒剂浸泡10～30min;③用去离子水清洗一遍;④将洗好的包装容器口朝下放在筐里，运到烘干室烘干;⑤将烘干后的包装容器运到无菌室，口朝上，用紫外灯照射30min备用。
(五)生产环境
未经洁净处理的空气中含有各种各样的微生物，可在化妆品的制造、静置、灌装、包装等环节对产品造成污染。
(六)操作人员
正常人的皮肤、手、毛发、衣服、鞋等均带有大量的微生物，参与生产的操作人员是化妆品生产中不容忽视的污染源，为了预防这类污染，应注意如下几项：①进入生产车间之前穿戴洁净的工作服、工作帽、工作鞋、口罩、手套等;②每次进入有洁净要求的区域开始工作时，都应彻底消毒洗手;③每次完成不卫生的动作或工作后，应彻底消毒洗手;④患有皮肤病、化脓性疾病、手指创伤或伤风感冒的人员应暂时调离与内容物直接有关的工作岗位。
