执业医师不能代替执业药师，执业医师证是在医院工作的上岗证，而执业药师证则是在药店工作的上岗证。
（一）执业药师：1执业药师是归属于药品监督系统的，执业药师通常指具有执业药师资格证书和执业药师注册证，并且在药品流通、生产、使用单位执业的药学技术人员。2、执业药师考试是以两年为一个周期，参与考试的人员必须在两个连续的考试年度通过考试以后，才能获取执业药师资格证书。3、执业药师一般是在药店工作，在取得执业药师资格证书后还要参加继续教育。执业药师虽然没有执业医师的处方权，但却有审方权，可以进行指导用药。（二）执业医师：1、执业医师的考试是国家医师类别的考试，执业医师的证书就相当于在医院工作的上岗证。医师资格考试的性质是行业准入性质，也是评价申请医师资格的人是否具有从事医师工作的知识与技能的考试。2、与执业药师不同的一点是，执业医师目前只有海南省、天津市和云南省的考生可以参与一年两试的试点，也就是在实践技能考试通过以之后，医学综合笔试第一次没有通过的，可以参与第二次考试。
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