相同点：行政单位和事业单位的资金来源基本都是国家划拨。行政单位为执行国家机关工作任务所需的资金，由各级政府财政部门从政府预算资金中分配和拨付，它是以收付实现制为记账基础,行政单位业务活动的目的是为了满足社会公共需要，具有明显的非市场性。与行政单位相比，事业单位的资金来源多渠道，支出使用多用途。事业单位的资金除了来源于政府财政拨款外，还有来源于上级、单位业务活动的的资金等；事业单位资金的支出使用，有用于开展专业业务活动的，有用于开展经营活动的，有用于对附属单位补助的，有用于上缴上级的等等。
不同点：事业单位对外没有监督和管理的职能.由于社会职能及资金来源、用途的不同，行政单位与事业单位在会计科目的设置与运用等方面具有各自的特点，以下我将按各会计要素分别进行简要说明。
1、行政单位预算管理
行政事业单位预算管理是财政部门同行政事业单位的主管部门之间，行政事业单位的主管部门同所属的行政事业部门之间关于财政资金的分配使用，领拨缴销的方法、形式，以及责任、权力与利益划分的基本组织制度。
现行行政事业单位的预算管理级次分为三级，即：
（1）．一级预算单位。
它直接向同级财政部门编报预算，领拨缴销预算资金。有些一级预算单位，同时负责核定所属单位预算，向所属单位转拨汇缴预算资金，也称为主管预算单位。
（2）．二级预算单位。
它向上一级预算单位或上级预算单位编报预算，领拨缴销预算资金，并负责核定所属单位的预算，向所属单位转拨汇缴预算资金。
（3）．三级预算单位，也称基层预算单位。
它向二级预算单位或直接向一级预算单位编报预算，领拨缴销预算资金，没有所属预算单位。
2、事业单位预算管理
业单位预算是指事业单位根据事业发展计划和任务编制的年度财务收支预算，是事业单位财务工作的基本依据，它反映了单位一个会计年度财务收支的规模。
事业单位开展业务活动所需的预算资金，国家采用“核定收支、定额或定项补助、超支不补、结余留用”的预算管理办法。
（1）．核定收支。它是指事业单位要将全部的收入，包括财政补助收入和各项非财政补助收人与各项支出统一编报预算报告，报经上级主管部门和财政部门核定其年度预算收支的规模，其中包括财政补助的具体数额。
（2）．定额或定项补助。它是指对非财政补助收入不能满足支出的事业单位采用的补助办法。所谓定额补助，是指根据事业单位的收支情况，依据相应的标准确定一个总的补助数额，如对高校实行的人均定额补助。所谓定项补助，是指根据事业单位的收支情况，确定对其某些支出项目进行补助，如对某些事业单位的工资支出项目给子补助或对大型修缮及设备购置进行的补助。
（3）．超支不补、结余留用。它是指事业单位的预算经上级部门和财政部门核准以后，由其自求平衡(除特殊情况外)，其增加的支出，主管部门和财政部门不再给予补助；因增收节支形成的结余，可由事业单位留用。另外少数非财政补助收入大于支出较多的事业单位，可按规定向国家上缴部分收入。
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