华科前身是1952年创办的四大工学院之一的华中工学院。
1953年5月，中华人民共和国高等教育部根据毛泽东的指示，决定将筹建中的华中机械学院、中南动力学院合并为一校，撤销中南动力学院的建制，机电互补，命名为华中工学院。由原武汉大学、湖南大学、南昌大学、广西大学等4所大学的机械系全部和电机系的电力部分，以及华南工学院机械系的动力部分、电机系的电力部分合并组成历经传承与发展。
2000年的全国高校合并浪潮中，武汉市政府初拟将华中理工大学（华中科技大学前身）与武汉大学合并，以建成全国首屈一指的名校。但合并便意味着华中理工大学将成为历史（在武汉，名字当然得改成武汉大学）。这遭到华中理工大学创始校长在内的多名重量级院士教授的强烈反对，并联名上书教育部阻止该方案通过。
武大，1952年，南昌大学、河南大学等校的水利系划归武汉大学，与武汉大学水利系合并成水利学院；武汉大学农学院从武汉大学分出，与湖北农学院合并成华中农学院（今华中农业大学）；哲学系并入北京大学，矿冶系调入中南矿冶学院（今中南大学）。
1953年，武汉大学工学院电机系电信部分，土木系建筑设计部分并入华南工学院（今华南理工大学），武汉大学土木系并入中南土木建筑学院（今湖南大学）；武汉大学机械系从武汉大学分出，参与组建华中工学院（今华中科技大学）；武汉大学外文系英文组并入中山大学。
所以总的说，华科的动机只和1950年代的武大有关，现在武大的动机主要是武水留下来的老师。华科和武大是好基友。