区别一：种类不同
三叶草是多种拥有三出指状复叶的草本植物的通称，主要包括三类：豆科的车轴草属（被认为是最正宗的三叶草）和苜蓿属、酢浆草科的酢浆草属中的某些种类。
草头是上海、太仓、常熟等地的人对南苜蓿（江浙地区称金花菜）的俗称。
区别二：外形不同
三叶草托叶卵状披针形，膜质，基部抱茎成鞘状，离生部分锐尖；叶柄较长，长10-30厘米；小叶倒卵形至近圆形，长8-20毫米，宽8-16毫米，先端凹头至钝圆，基部楔形渐窄至小叶柄。
中脉在下面隆起，侧脉约13对，与中脉作50°角展开，两面均隆起，近叶边分叉并伸达锯齿齿尖；小叶柄长1.5毫米，微被柔毛。
草头羽状三出复叶；托叶大，卵状长圆形，长4-7毫米，先端渐尖，基部耳状，边缘具不整齐条裂，成丝状细条或深齿状缺刻，脉纹明显；叶柄柔软，细长，长1-5厘米，上面具浅沟；小叶倒卵形或三角状倒卵形，几等大，长7-20毫米。
区别三：分布不同
三叶草原产欧洲和北非，世界各地均有栽培。作为培育牧草品种最多的国家有澳大利亚、新西兰、英国、丹麦和荷兰。其它国家，如瑞典、德国、美国、法国、意大利、加拿大和波兰的育种家们也培育出许多著名品种。
在中国南到云南的勐腊县，北到黑龙江的尚志县均有野生种和栽培种的分布。中国的野生种和引进大面积推广种植的种或品种约有10余个，引入试种过的种或栽培品种有200余个，仅云南省就引入栽培过14个种162个品种。
草头产自长江流域以南各省区，以及陕西、甘肃、贵州、云南。常栽培或呈半野生状态。欧洲南部、西南亚，以及整个旧大陆均有分布，并引种到美洲、大洋洲。
参考资料来源：百度百科—三叶草
参考资料来源：百度百科—草头
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