机关事业单位公积金的公积金比例，依照《住房公积金管理条例》的相关规定，最少为上月本人工资的5%，个人和单位依照同比例交纳。只需部门的依照不少于自己上月职工薪酬的5%交纳就是违法的，假如公积金比例小于5%，或是不交纳公积金才归属于违反规定。
公积金的公积金比例幅度非常大，从5%到12%这个范围之内，随意挑选其中的一个公积金比例开展存缴都是违法的，有些单位为依照6%比例交纳，有些是是依据10%比例交纳，还有的单位为依照12%比例交纳，这些都是违法的，反过来小于5%的公积金比例，例如依照4%比例存缴，或者高过12%，依照12.5%或者13%比例存缴全是非法的。
分辨一个单位存缴的公积金是否合法，关键是以缴存基数，公积金比例来作出判断。依照公积金管理办法的相关规定，员工公积金的月存缴额为员工自己上一年度月平均收入乘于员工住房公积金缴存占比。企业为员工存缴的社保公积金的月存缴额为员工自己上一年度月平均收入乘于企业住房公积金缴存占比；新参加工作的员工从参加工作的第二个月逐渐缴存，月存缴额为员工自己当月薪水乘于员工住房公积金缴存占比；企业新加入职工从调进企业发工资之日起缴存，月存缴额为员工自己当月薪水乘于员工住房公积金缴存占比。
从公积金比例去分析，员工与单位公积金的公积金比例均不能低于员工上一年度月平均收入的5％；有必要的大城市可以稍微提升公积金比例。机关事业单位实际公积金比例多少钱，严格按照企业所在城市要求去执行，因为机关事业单位也有主管机构，有时候要根据主管机构的的需求去执行，针对财政全额拨款的部门，要根据本地财政局统一的要求去执行，自自收自支事业编，要根据部门的收支明细来确定，从这一层面来说，本部门住房公积金缴存比例是多少，本公司领导是没法作出决定的。
总的来说，事业单位个人公积金缴纳，只需是依据公积金管理办法的相关规定与当地政府机构的有关规定，依照自己上一年度月平均收入来作缴存基数，缴存比例在5%或以上都是违法的，假如我们企业没交纳公积金，或者缴存基数不按照自己上一年度员工的月平均收入做为缴存基数，公积金比例小于5%,，那便是非法的，可向事业单位领导干部或者上级主管单位体现。