新生儿交农村合作医疗保险要准备以下材料：
1、户口本以及复印件。户口本要带上原件和复印件，复印件一定要复印户口本首页和宝宝那一页。
2、身份证及复印件/身份证号码。一般办理医保是需要本人的身份证，因为有些地方办理身份证的年龄要求不一样，如果没有身份证的，就需要提供身份证号码。
办理流程：
1、按照指定时间，带着准生证，户口本，结婚证，到医院办理出生证。
2、带着出生证，户口本，到当地社区服务中心的计划生育办公室办理一份证明，拿着证明和前面两样到当地派出所给孩子落户口。
3、拿着孩子的户口本和出生证，到指定银行给孩子开个户，填写新生儿保险账户，办理一张保险卡。
4、带着出生证，户口本，保险卡，到社区的社保办理处办理新生儿医保卡。