（一）动物区系的组成
调查区所在的可可西里国家级自然保护区分布的哺乳动物有30种，鸟类54种，爬行类1种，鱼类6种。名录如下：
哺乳纲（MAMMALIA）
食肉目（CARNIVORA）
猫科（Felidae）
1.雪豹（Panthera uncia）
2.猞猁（Lynx lynx）
3.兔狲（Felis manul）
犬科（Canidae）
4.狼（Canisl upus）
5.豺（Cuon alpinus）
6.赤狐（Vulpes vulpes）
7.藏狐（Vulpes ferrillata）
8.沙狐（Vulpes corsac）
熊科（Ursidae）
9.棕熊（Ursus arctos）
鼬科（Mustelidae）
10.石貂（Martes foina）
11.香鼬（Mustela altaica）
12.艾虎（Mustcla eversmanni）
13.狗獾（Meles meles）
奇蹄目（PERISSODACTYLA）
马科（Equidae）
14.藏野驴（Equus kiang）
偶蹄目（ARTIODACTYLA）
牛科（Bovidae）
15.野牦牛（Poephagus mutus）
16.藏原羚（Procapra picticaudata）
17.盘羊（Ovis ammon）
18.岩羊（Pseudois nayaur）
19.藏羚（Pantholops hodgsoni）
鹿科（Cervidae）
20.白唇鹿（Cervus albirostris）
啮齿目（RODENTIA）
松鼠科（Seiuridae）
21.喜马拉雅旱獭（Marmota himalayana）
仓鼠科（Cricetidae）
22.藏仓鼠（Cricetulus kamensis）
23.长尾仓鼠（Cricetulus longicaudatus）
田鼠科（Arvieolidae）
24.斯氏高山平（Altacola stoliczkanus）
25.白尾松田鼠（Pitymys leucurus）
跳鼠科（Dipodidae）
26.长耳跳鼠（Euchoretes naso）
兔形目（LAGOMORPHA）
鼠兔科（Ochotonidae）
27.黑唇鼠兔（Ochotona curzoniae）
28.柯氏鼠兔（Ochotona koslowi）
29.拉达克鼠兔（Ochotona ladacensis）
兔科（Leporidae）
30.高原兔（Lepus oiostolus）
鸟纲（AVES）
鹳形目（CICONIFORMES）
鹭科（Ardeidae）
1.大白鹭（Egretta alba）
雁形目（ANSERIFORMES）
鸭科（Anatidae）
2.斑头雁（Anser indicus）
3.大天鹅（Cygnus cygnus）
4.赤麻鸭（Taborna ferruginea）
5.赤嘴潜鸭（Netta rufina）
隼形目（FALCONIFORMES）
鹰科（Accipitridae）
6.大鵟（Buteo hemiasius）
7.金雕（Aquila chrysaetos）
8.草原雕（Aquila rapax）
9.秃鹫（Aegypius monachus）
隼科（Faconidae）
10.猎隼（Faico cherrug）
11.红隼（Falco tinnunculus）
鸡形目（GALLIFORMES）
雉科（Phasianidae）
12.藏雪鸡（Tetraogallus tibetanus）
鹤形目（GRUIFORMES）
鹤科（Gruidae）
13.黑颈鹤（Grus nigricollis）
鸻形目（CHARADRIIFORMES）
鸻科（Charadriidae）
14.斑鸻（Pluvialis dominca）
鹬科（Scolopacidae）
15.红脚鹬（Tringa totanus）
16.矶鹬（Tringa hypoleucos）
鸽形目（COLUMBIFORMES）
沙鸡科（Pteroclididae）
17.西藏毛腿沙鸡（Syrrhaptes tibetanus）
鸠鸽科（Columbidae）
18.岩鸽（Columba rupestris）
佛法僧目（CORACIIFORMES）
戴胜科（Upupidae）
19.戴胜（Upupa epops）
鸥形目（LARIFORMES）
鸥科（Laridae）
20.鱼鸥（Larus ichthyaetus）
21.棕头鸥（Larus brunnicephalus）
22.普通燕鸥（Sterna hirundo）
雀形目（PASSERIFORMES）
百灵科（Alaudidae）
23.长嘴百灵（Melanocorypha maxima）
24.短趾沙百灵（Calandrella cinerea）
25.细嘴沙百灵（Calandrella acutirostris）
26.角百灵（Eremophila alpestris）
27.小云雀（Alauda gulgula）
燕科（Hirundinidae）
28.灰沙燕（Roparia riparia）
29.岩燕（Ptyonoprpgne rupestris）
30.毛脚燕（Delichon urbica）
鹡鸰科（Motacillidae）
31.黄头鹡鸰（Motacoilla citreola）
32.白鹡鸰（Motacoilla alba）
33.平原鹨（Anthus campestris）
34.水鹨（Anthus spinoletta）
鸦科（Cervidae）
35.褐背拟地鸦（Pseudopodoces humilis）
36.红嘴山鸦（Pyrrhocorax pyrrhocorax）
37.渡鸦（Corvus corax）
伯劳科（Laniidae）
38.楔尾伯劳（Lanius tephronotus）
岩鹨科（Prunellidae）
39.棕胸岩鹨（Prunella strophiata）
40.褐岩鹨（Prunella fulvescens）
鶲科（Muscicapidae）
41.蓝点颏（Lusinia calliope）
42.赭红尾鸲（Phoenicurus ochruros）
43.漠即（Oenanthe isellini）
44.黑喉石即（Saxicola torquata）
45.棕背鸫（Turdus kessieri）
文鸟科（Ploceidae）
46.石雀（Petronia peteronia）
47.棕背雪雀（Montifrgilla blanfordi）
48.黑喉雪雀（Montifrgilla davidiana）
雀科（Fringillidae）
49.曙红朱雀（Carpodacus eos）
50.高山岭雀（Leucosticte nemoricola）
51.大朱雀（Carpodacus rubicilla）
52.拟大朱雀（Carpodacus rubicilleides）
53.红眉朱雀（Carpodacus pulcherrimus）
54.灰眉岩鹨（Emberiza cia）
爬行纲（REPTILIA）
蜥蜴目（LACERTIFORMES）
鬣蜥科（Agamimdae）
1.青海沙蜥（Phrynocephalus vliangalii）
鱼纲（PISCES）
鲤形目（CYPRINFORMES）
鲤科（Cyprinidae）
1.裸腹叶须鱼（Ptychobarbus kaznakovi）
2.小头裸裂尻鱼（Schizopygopsis microcephalus）
鳅科（Cobitidae）
3.长鳍高原鳅（Tripiophysa（T.）longianalis）
4.细尾高原鳅（Tripiophysa（T.）stenura）
5.细体高原鳅（Tripiohysa（T.）leptosoma）
6.小眼高原鳅（Tripiophysa（T.）microps）
（二）动物区系分布的特点
由于本区地势高亢，气候干旱寒冷，植被类型简单，食物条件及隐蔽条件较差，动物区系组成简单。但是，除猛兽猛禽多单独营生外，有蹄类动物具结群活动或群聚栖居的习性，因而种群密度较大，数量较多，这是青藏高原东部及南部森林动物不能比拟的。
本区动物区系的组成特征主要表现在：
1）哺乳动物特有种占重要地位。可可西里地区的青藏高原特有种计有11种之多，其中最著名的物种有藏羚、藏野驴、野牦牛和藏原羚等；具有产业意义的种类有喜马拉雅旱獭（Marmotahimalayana）和高原兔（Lepus oioslolus ）；具有一定科研价值或在食物链中起到生态平衡作用的小型动物，有多种鼠兔（Ochotona spp.）和松田鼠（Pitymys leucuius）等。分布于欧亚北大陆或中亚地区，并见于可可西里的古北界种类有17种，这些种类为棕熊、猞猁、盘羊、岩羊和小毛足鼠等。狼系本区唯一的广布种。
综上所述，可可西里地区哺乳动物的区系组成别具特色。原因是本区远离塔里木盆地和柴达木盆地，一些中亚或蒙新区较为典型的荒漠、半荒漠种类及其他北方种类，未能扩展到本区，致使古北界物种的成分明显减少。
2）鸟类以古北界成分居优势。鸟类的区系组成与哺乳类恰恰相反，即古北界种较多，而特有种仅7种（如：藏雪鸡、褐北拟地鸦、长嘴百灵、雪雀等），余为广布种，候鸟占一定比例，偶尔有大白鹭等迷鸟出现。
3）本区自东南至西北方向虽然分别出现高寒草甸、高寒草原及高寒荒漠草原植被类型，但大、中型哺乳动物（如：藏野驴、野牦牛、藏羚、藏原羚等）均可见于上述各植被带，即无明显的地域差异，但在种群数量上会有一定的差别。例如，藏原羚喜在草甸和草原环境中栖息，数量相对较多，在气候更加干旱的荒漠草原带中较少见，甚至绝迹。
4）不同的植被类型，小型哺乳动物的组成也略有差异。黑唇鼠兔（Ochotona curzoniae）在高寒草甸，拉达克鼠兔（Ochotana ladacensis）却栖息于高寒草原及荒漠草原；而荒漠类型的小毛足鼠（Phodpus roborovskii）仅在本区西北隅的荒漠中出现。
（三）濒危珍稀动物
青海可可西里地区濒危珍稀的兽类有13种，其中含国家一级保护动物5种，即雪豹、藏野驴、野牦牛、藏羚、白唇鹿；二级保护动物有8种，即棕熊、猞猁、兔狲、豺、石貂、岩羊、盘羊、藏原羚；珍稀鸟类计有8种，含一级保护动物2种，即金雕、黑颈鹤；二级保护动物有6种，即秃鹫、猎隼、大鵟、红隼和藏雪鸡、大天鹅。
濒危珍稀动物中最引人关注的是藏羚羊，以其珍贵的绒毛，而遭到不法分子的大规模猎杀。藏羚（Pantholops hodgsoni），英文名：Tibetan antelope或Chiru，中文别名：藏羚羊、长角羊，藏名译音：Zu。分类：偶蹄目、牛科、藏羚属（Pantholops）。肩高：80～85cm（雄），70～75cm（雌）；体重：35～40kg（雄），24～28 kg（雌）；毛色：雄羊黄褐色到灰色，腹部白色，额面和四条腿有醒目黑斑记，雌羊纯黄褐，腹部白色；角长：成年雄性50～60cm（雌性无角）；寿命：一般不超过8岁；习性：集成十几到上千只不等的种群，生活在海拔4 300～5 100 m（最低3 250 m，最高5 500 m）的高山草原、草甸和高寒荒漠上。夏季（5月）雌性沿固定路线向北迁徙至东昆仑山脉北麓一带，调查区是藏羚羊迁徙的途经地区，6～7月产仔之后返回越冬地与雄羊合群，11～12月交配，只有少数种群不迁徙，目前藏羚羊迁徙的原因还不明确，有待于动物学家的研究。分布：只限青藏高原，以羌塘为中心，南至拉萨以北，北至昆仑山，东至西藏昌都地区北部和青海西南部，西至中印边界，偶尔有少数由此流入印度境内拉达克。数量：少于75 000只（据夏勒1999年估计），保护级别：国家一级保护动物。
野牦牛（Poephagus mutus），偶蹄目，牛科，牛亚科、牦牛属。青藏高原特有种，国家一级保护动物，是家牦牛的野生同类。野牦牛体形笨重、粗壮，成年个体肩高1.3 m上，体长2.0 m以上，体重1 000 kg以上，而雄性个体明显大于雌性个体；雌、雄个体均有角，角形相似，雄体的角明显比雌性的角大而粗壮，毛色绝大多数呈通体褐黑色，仅吻周、嘴唇、脸面及脊背一带显霜状的灰白色。该物种是典型的高寒动物，性极耐寒，其分布高度在海拔4 000～5400 m之间，在高寒草原或荒凉的寒漠地区，每天大部分时间均在进行摄食，边食边漫游，无十分固定的栖居地，只有大致的分布区。营群居生活，除个别雄性个体常单独生活外，一般总是雌雄老幼活动在一起，少则数头，多则数百头甚至上千头。据有关资料表明，雄性野牦牛3岁性成熟，每年进入秋季后，野牦牛陆续开始交配，雄牛生性凶猛好斗，在交配之间争偶现象非常激烈，胜者率领数只到20多只雌牛一起活动，败者往往尾随群体伺机交配，或离开群体另觅新欢。怀胎雌牛每年6～7月份产仔，妊娠期240～250天，每胎一仔。成群的野牦牛会主动逃避敌害，遇到人或汽车也会跑走，而性情凶狠暴戾的孤牛则恰恰相反，常会主动攻击在它面前经过的各种对象，能将行驶中的吉普车顶翻，受到伤害的野牦牛不论雌雄，都会拼命攻击敌害，直到力竭死亡，野牦牛发起攻击时首先会竖起尾巴示警，因此在野外工作中必须掌握野牦牛这一特点。野牦牛的主要天敌是狼群，后者常在冬季以围攻的方式将老龄、幼龄和体弱的野牦牛追到冰上，待其滑倒后群起撕食。