法律分析：承包经营权证书与土地使用证书性质不同，前者一般是指农村土地山林承包用于农业生产的，后者一般是除农业生产外的用途，后者需要与国家相关部门签订土地使用协议办理相关手续，土地承包经营与农村集体组织签订。土地使用证书的全称为土地权利证书，是指依法确认土地所有权、使用权的法律凭证。由县级人民政府颁发，土地管理机关填发，土地权属单位保存
法律依据：《农村土地承包经营权管理办法》
第二条 农村土地承包经营权流转应当在坚持农户家庭承包经营制度和稳定农村土地承包关系的基础上，遵循平等协商、依法、自愿、有偿的原则。
第三条 农村土地承包经营权流转不得改变承包土地的农业用途，流转期限不得超过承包期的剩余期限，不得损害利害关系人和农村集体经济组织的合法权益。