农合和医保主要区别有针对人群不同、缴费方式不同、待遇不同和退休年龄不同。
1、针对人群不同
新农合的全称是：新型农村合作医疗，农民每人每年出一些钱，国家再补贴一些钱，共同建立的基本医保制度。必须是农村户口才能参加新农合。针对的人群是没有在城镇务工的农民。
医保的全称是：城镇职工基本医疗保险，不限户籍，由个人缴费部分和统筹缴费部分构成。主要针对的人群是在职职工和灵活就业人员。
2、缴费方式不同
新农合一年一交，由个人缴费。医保通常一月一缴费，有单位由单位承担统筹部分。灵活就业个人要承担部分统筹缴费。
3、待遇不同
农合主要针对农民，缴费少，报销额度也低，比例在50%左右。医保主要针对职工和灵活就业人员，缴费高，待遇也高，报销比例在90%左右。
4、退休年龄不同
城镇职工医保在到达退休年龄，满足当地医保退休年限要求后，可以医保退休，终生免费享受医保待遇。新农合没有退休政策，终生缴费。
新农合减免交费人群
第一、重度残疾人
新农合是一种普惠性医疗，对于生活困难的人群都有优惠政策，而作为重度残疾人，指的是一级、二级伤残人士大多数地区都是全部减免新农合费用，有财政代交，可以享受与交费人群的同等待遇。其实即便要求重疾人士交钱也是没钱交的，不仅没有收入，还要别人照顾，如果不减免，那么国家的兜底就是名不副实了。
第二、社会优抚对象
社会优抚人员包括农村五保老人、孤儿、低保户、建卡立档户、残疾军人、三属人员等群体，都享受国家财政补助，很多都是家庭生活困难的群体，多数也都没有主要劳动力，没有稳定的收入来源。
当然，这些人员并不是全部减免，有些是减免一半或者大半，有些则是减免几十块钱，但是相较于全额缴费来说还是缴纳得很少的。
第三、农村高龄老人
对于农村高龄老人的定义基本上在70周岁以上，根据2017年国家统计局与卫健委联合发布《全国各省的平均寿命排行》统计，农村居民的人均寿命仅有68岁，远低于现在全国人均预期寿命78.2岁。所以说在农村70岁的老人就是高龄了。
医保与农保区别如下：
1、概念不同
社会医疗保险亦称“疾病社会保险”或“健康社会保险”。被保险人因疾病、负伤、残废等造成收入中断及医疗费用的损失，由保险组织提供物质帮助的一种社会保险。
新型农村合作医疗是指由政府组织、引导、支持，农民自愿参加，个人、集体和政府多方筹资，以大病统筹为主的农民医疗互助共济制度。其采取个人缴费、集体扶持和政府资助的方式筹集资金。
2、参保对象不同
农村合作医疗指凡户籍在该地，出生90天以后的农村居民及没有参加城镇职工基本医疗保险的城镇居民均可参加、未参加城镇职工基本养老保险的农村居民，可在户籍地自愿参保。医疗保险是在参加工作的，有部分由自己缴纳，一部分由公司缴纳。
3、缴费费用和方式不同
农村医保缴纳的费用一年几百元，而社保缴纳费用一年几千甚至上万，相比之下农村医保的费用低很多。农村医保是由参保人负担全部费用，而社保是由职工和公司一起承担费用的。
城镇职工医疗保险按月缴费且设立最低缴费年限，达到缴费年限(男25年、女20年)的，退休后不再缴费即可享受基本医疗保险待遇。新型农村合作医疗是按年度缴费且要终身缴费，不缴费不享受待遇。
医保的全称为社会医疗保险，是为劳动者提供患病时基本医疗需求建立的社会保险。
农保则是由主管部门负责组织和管理，农村经济组织、集体事业单位和各业劳动者共同承担养老保险费缴纳义务，劳动者在年老时按照养老保险费缴纳状况享受基本养老保险待遇的农村社会保险。
新农保和社保主要的区别就是对象不同：农保针对的人群是在家务农，没有出来城镇务工的农民。