在比较深圳第三高级中学初中部和福田第二实验北校区时，我们可以从以下几个方面进行考量：
学校概况：
深圳第三高级中学初中部：作为深圳第三高级中学的初中部，该校以培养出2名国际数学奥林匹克国家冬令营金牌获得者和1名银牌获得者以及一大批德智体全面发展的优秀学生而著称。近八年来，学校高考上线率均保持在99%左右，显示出其优质的教学质量。
福田第二实验北校区：作为福田区属公立九年一贯制学校的一个校区，该校在福田区排名中表现良好，但具体的深圳排名并未公布。该校拥有现代化的教学设施和优秀的师资力量，为学生提供了良好的学习环境。
教学质量：
深圳第三高级中学初中部：教学质量较高，近八年来高考上线率稳定在99%左右，并且培养出多名优秀学生进入国内外顶尖高校。
福田第二实验北校区：作为福田第二实验学校的一部分，其教学质量也得到了较好的保障，但具体的升学率和优秀学生培养情况在参考文章中并未提及。
师资力量：
福田第二实验北校区：该校拥有以全国“好校长”、广东省优秀教师等为核心的领导团队，教师队伍中高级职称、硕士研究生和博士研究生学历的比例较高，特级教师、省级、市级优秀教师等各级名师也占有一定比例。
深圳第三高级中学初中部的具体师资信息在参考文章中并未详细提及，但可以推测其作为知名学校的一部分，师资力量同样较为强大。
设施与环境：
福田第二实验北校区：校园建筑新颖时尚，环境美丽优雅，拥有现代化的教学设施和多功能体育场馆等。
深圳第三高级中学初中部的设施和环境情况在参考文章中并未具体提及。
学校声誉和排名：
深圳第三高级中学初中部：作为深圳知名学校的一部分，其声誉和排名较高。
福田第二实验北校区：在福田区排名中表现良好，但具体的深圳排名并未公布。
综上所述，深圳第三高级中学初中部和福田第二实验北校区各有优势。深圳第三高级中学初中部以优异的教学质量和升学率著称，而福田第二实验北校区则拥有优秀的师资力量和现代化的教学设施。在选择时，建议家长和学生根据自身的需求和兴趣进行综合考虑。