第1个回答 2009-07-15
第五部 第十三部
黑暗组织在剧场版出现的次数不是很多，TV版中还是很多的：
001 云霄飞车杀人事件
005 新干线大爆破事件
013 奇怪的寻亲杀人事件
054 电玩公司杀人事件
128 黑暗组织10亿元抢劫事件
129 来自黑暗组织的女子 大学教授杀人事件
170 黑暗之中的死角（前篇）
171 黑暗之中的死角（后篇）
176 与黑暗组织的再会(灰原编)
177 与黑暗组织的再会(柯南编)
178 与黑暗组织的再会(解决编)
226 战斗游戏的陷阱（前篇）
227 战斗游戏的陷阱（后篇）
230 迷一样的乘客(前编)
231 迷一样的乘客(后编)
258 来自芝加哥的男人（前篇）
259 来自芝加哥的男人（后篇）
284 中华街雨中的似曾相识(前编)
285 中华街雨中的似曾相识(后编)
286 工藤新一NY事件(事件编)
287 工藤新一NY事件(推理编)
288 工藤新一NY事件(解决编)
307 没有留下声音的证据(前编)
308 没有留下声音的证据(后编)
309 与黑暗组织接触(交涉编)
310 与黑暗组织接触(追击编)
311 与黑暗组织接触(决死编)
340 厕所隐藏的秘密（前篇
341 厕所隐藏的秘密（后篇
345 与黑衣组织直面对决满月之夜的双重迷案
425 黑色的冲击！黑色组织魔爪伸来的瞬间
462 黑衣组织的魅影 年幼的目击者
463 黑衣组织的魅影 奇妙的照明
464 黑衣组织的魅影 谜一样的高额报酬
465 黑衣组织的魅影 珍珠般的流星
466 坚不可摧的雪人（前篇）
467 坚不可摧的雪人（后篇）
479 和服部平次在一起的3天
484 黑色照片的行踪（前篇）
485 黑色照片的行踪（后篇）
491 红与黑的碰撞 开端
492 红与黑的碰撞 血缘
493 红与黑的碰撞 疾呼
494 红与黑的碰撞 冥土
495 红与黑的碰撞 昏睡
496 红与黑的碰撞 侵入
497 红与黑的碰撞 觉醒
498 红与黑的碰撞 扰乱
499 红与黑的碰撞 伪装
500 红与黑的碰撞 遗言
501 红与黑的碰撞 嫌疑
502 红与黑的碰撞 洁白
503 红与黑的碰撞 决死
504 红与黑的碰撞 殉职
509 红白黄色与侦探团
518 新一身份的危机
漫画版
01/01 001 现代的福尔摩斯
01/02 002 变成小孩子的名侦探
12/04 114 突如其来的遭遇
12/05 115 炸弹的下落
12/06 116 柯南失算了
18/06 176 转学生
18/07 177 黑衣女郎
18/08 178 秘密组织成员·
18/09 179 伪装的少女
18/10 180 将死
19/01 181 为什么？
19/09 189 被狙击的球！
19/10 190 5万6千名人质
20/01 191 远方之眼
24/07 238 背叛的街角
24/08 239 漆黑的丧葬行列
24/09 240 不告而别
24/10 241 来自过去的子弹
24/11 242 白色世界
29/03 287 看不见的恐怖
29/04 288 危险讯号
29/05 289 光天化日下的埋
34/11 350 金苹果（1）
35/01 351 金苹果（2）
35/02 352 金苹果（3）
35/03 353 金苹果（4）
35/04 354 金苹果（5）
37/05 377 黑暗的足迹（1）
37/06 378 黑暗的足迹（2）
37/07 379 黑暗的足迹（3）
37/08 380 白雪…黑影…
37/09 381 危险的相遇
37/10 382 顺风车
38/01 383 新兵器！
41/10 423 到访者留下的谜
41/11 424 小小密室的秘密
42/01 425 隐藏的真相
42/05 429 月圆之夜和黑宴
42/06 430 染血的幽灵船
42/07 431 隐形人出现
42/08 432 工藤新一登场
42/09 433 面具下的真相
42/10 434 腐坏的苹果
48/09 499 门铃怪客
48/10 500 新的黑衣组织成员
49/01 501 追踪目标！
49/02 502 新的指令！
49/03 503 黑衣组织vsFBI
49/04 504 黑衣组织vsFBI
53/07 550 目击者一人
53/08 551 钉子与蛇
53/09 552 锤子的真面目
53/10 553 不可思议的兼职
54/01 554 晚餐的菜单
54/02 555 梦中之星