一、含义不同：
1、工商管理硕士，全称为工商管理类硕士研究生(英文名为Master of Business Administration,简称MBA)。该学位的设立，旨在培养能够胜任工商企业和经济管理部门高层管理工作需要的务实型、复合型和应用型高层次管理人才。
2、工程管理硕士（Master of Engineering Management，简称MEM）是2010由中国工程院提议，委托清华大学进行学科论证，同年批复新设置的一种专业学位。工程管理是针对工程实践而进行的决策、计划、组织、指挥、协调与控制。
二、报考条件不同：
考生的学历必须符合下列条件之一：
1、具有国家承认的大学本科毕业学历后，有三年或三年以上工作经历者。
2、已获硕士、博士学位，并有两年或两年以上工作经历者。
3、获得国家承认的大专毕业学历后，有五年或五年以上工作经历
4、MBA各校还可能在教育部门规定的MBA报考条件基础上制定本校的报考条件。比如清华大学，对大专毕业生考生，要求有突出的工作业绩（相关证明、业绩报告）。
或者有达到学士学位水平的，与工商管理专业相关的论文 （1万字以上）；须通过国家大学英语CET四级考试。
三、学科不同：
1、MEM：综合试卷满分为200分，英语试卷满分100分，共300分，考试时间各为180分钟。
2、MBA入学考试笔试科目为二门，分别是：英语二（注：“英语一”一般都是普研，专业硕士考“英语二”）、管理综合（含数学、逻辑、写作）。
比较而言MBA主要侧重于培养财务、市场、组织管理等方面的综合技能。MEM注重于项目管理以及某行业/领域的技术专长等，同时适度补充财务、管理和市场方面的知识，以及增长国际交流经验。
扩展资料：
选择高校技巧：
1、学校品牌：依托名校的MEM一般在教学质量上会有更好的保障。学校对MEM专业的重视程度，是否有专门的MEM教育管理部门也是需要考量的因素。
2、不同的院校有不同的特色，务必要根据自己所在的行业来选择对应的院校和专业。
3、看师资和授课方式：MEM师资需要重点关注，知名教授、博士、国外学者、企业家的数量和水平是反映师资力量的重要方面。MEM注重实战，教授是否运用大量的案例分析、互动灵活的教学方式都可以事先了解。
4、看就业情况：要确定自己读MEM的价值，可先了解学校能提供的机会。
5、看校友资源：学校是否提供高质量的校友网络与是否经常组织校友交流也是值得关注之处。
参考资料：百度百科-工程管理硕士（MEM)
参考资料：百度百科-工商管理硕士(MBA)