论文的参考文献的类型有多种，如图书、期刊论文、学位论文、专利文献等等，用不同的参考文献类型标识码表示，GB7714-2015《信息与文献 参考文献著录规则》给出的如下规则：
参考文献类型和标识代码
普通图书 M，会议录 C，汇编 G，报纸 N，期刊 J，学位论文 D，报告 R，标准 S，专利 P，数据库 DB，计算机程序 CP， 电子公告 EB，档案 A，舆图 CM， 数据集 DS，其他 Z。
电子资源载体类型和标识代码
磁带 MT，磁盘 DK，光盘 CD，联机网络 OL。
对于电子资源的参考文献需要标注载体和文献类型代码，如，联机网络的电子公告代码为[EB/OL]
示例
[1] 余向春. 化学化工信息检索与利用[M]. 3版. 大连：大连理工大学出版社，2008：85-90.
[2] 何龄修. 读南明史[J]. 中国史研究，1998，（3）：167-173.
[3] 有着谁の. 参考文献标准格式[EB/OL]. （2016-08-26）[2017-12-15]. hhh,https://zhidao.baidu.com/question/1052808558570240459.html?entry=qb_uhome_recommend.
所以说，你的问题“参考文献MDZ什么意思”中，M表示图书，D表示学位论文，Z表示其他文献类型。