南京医科大学好。
1、从师资力量方面分析：
南京医科大学学校校本部有在职教职工1800多人，其中学校编制专任教师945人。有教授218人、副教授280人，有博士生导师752人、硕士生导师2312人。学校现有中国工程院院士2名，美国国家医学院外籍院士1名，国家级教学名师1人，全国优秀教师1人，江苏特聘教授32人，“国家级教学团队”3个，教育部“创新团队”1个。
徐州医科大学有教职工有5000余人（含直属附院），博士生和硕士生导师近700人，有“长江学者”特聘教授1人，国家级和省级优秀教学团队2个，省级科技创新团队8个，享受政府特殊津贴专家22人，江苏特聘教授6人，江苏特聘医学专家3人，入选省“双创计划”、省“333”工程、“六大人才高峰”等各类人才项目近200人次。
2、从学科建设方面分析：
南京医科大学有一级学科博士学位授权点8个、二级学科博士学位授权点54个、3个交叉学科博士学位授权点（临床医学工程、人文医学、健康政策管理）；一级学科硕士学位授权点12个、二级学科硕士学位授权点67个；博士后科研流动站7个。
学位授权点已覆盖医学、理学、工学、管理学、法学、教育学和文学等7个学科门类；拥有3个国家重点学科、1个国家重点（培育）学科、29个国家临床重点专科、6个江苏高校优势学科（三期）、2个江苏省一级学科重点学科、3个江苏省一级学科重点培育学科。
徐州医科大学拥有国家级重点学科建设培育点1个；省级重点学科6个，“十二五”高校重点专业4个，省级医学重点学科和重点临床专科19个，拥有2个博士学位授权一级学科，临床医学、基础医学、生物学、药学、公共卫生与预防医学5个硕士学位授权一级学科和临床医学、药学2个专业学位授权点。
学院具有硕士研究生推免权，并设有2个博士后科研工作站。临床医学学科ESI排名全球前1%。
扩展资料：
南京医科大学的优点：
南京医科大学是首批教育部、国家卫生和计划生育委员会、江苏省共建高校和江苏高水平大学建设高校，校本部在职教职工1700多人，其中学校编制专任教师884人；拥有中文（外文）纸质图书、电子图书、全文电子期刊共一千多万册。
临床医学学科进入ESI全球排名前1‰。在全国第四轮学科评估中，学校公共卫生与预防医学在全国54所参评高校中获评A+等级。2019年，学校获得291项国家自然科学基金项目资助，项目数位居独立设置医科大学第1位。
徐州医科大学的优点：
徐州医科大学简称“徐医大”，是江苏省和徐州市重点建设的医药类大学，徐州医科大学占地1200余亩，有4个校区，学校拥有全日制在校生有11000多人，其中全日制本科生9603人，硕士、博士研究生1481人，学历教育留学生263人，学校面向国内16个省市、港澳台地区以及国外招生。
参考资料来源：
毫无疑问就是南京医科大学完胜徐州医科大学。
两者之间根本无可比性。