嘉兴市地处北亚热带南缘，属东亚季风区，冬夏季风交替显著，四季分明，气温适中，雨水丰沛，日照充足，具有春湿、夏热、秋燥、冬冷的特点，因地处中纬度，夏令湿热多雨的天气比冬干天气短得多。
年平均气温15.9℃。1月份最冷，月平均气温3.6℃；极端最低气温－11.9℃�出现在1977年1月31日；7月份最热，月平均气温28.1℃；极端最高气温39.4℃，出现在1953年8月26日；日平均气温稳定通过10℃的平均回暖初日在4月1日，平均结束日在11月18日；平均终霜日在3月27日，平均初霜日在11月13日，平均无霜期230天；平均初冰日在11月27日。
年平均降水量1168.6毫米。最多年降水量1720毫米出现在1954年；最少年降水量757毫米出现在1978年。全年有3个明显的降水时段即4～5月的春雨；6～7月的梅雨和9月的秋雨；1月是下雪最多的月份。
年平均日照2017小时。其中以7、8月最多，月平均日照分别为239、241小时；1、2月最少，月平均日照分别为134、124小时；年平均蒸发量1313毫米；年平均相对湿度81％。
主要的灾害性天气有暴雨、连阴雨、干旱、寒潮、大雪、大雾、高温和台风热带气旋等。
嘉兴市境地势低平，平均海拔3.7米（吴淞高程），其中秀洲区和嘉善北部最为低洼，其地面高程一般在3.2米～3.6米之间，部分低地2.8米～3.0米。
全市有山丘200余个，零散分布在钱塘江杭州湾北岸一线，海拔大多在200米以下，市境最高点是位于海盐与海宁交界处的高阳山。市境为太湖边的浅碟形洼地，地势大致呈东南向西北倾斜，由于数千年来人类的垦殖开发，平原被纵横交错的塘浦河渠所分割，田、地、水交错分布，形成“六田一水三分地”，旱地栽桑、水田种粮、湖荡养鱼的立体地形结构，人工地貌明显，水乡特色浓郁。
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