杭州站和杭州东站没有什么本质上的区别，都是火车站，只不过站点不同，会停靠的火车也不尽相同。如果需要到杭州乘坐火车，最好乘坐之前确认自己是在这两个站的哪个站，不要坐错了就行。
不过，两者还是有一个很明显的区别，就是杭州东站历史没有杭州站那么悠久，而且，一般的动车都是从杭州站出发的。除此之外，就没有了。
注：
杭州站，位于浙江省杭州市清泰门，建于1906年11月14日，杭州本地人称“城站”，隶属中国铁路上海局集团有限公司管辖，现为一等站。车站始建于1906年（清光绪三十二年），时称清泰站，是杭州建成最早的火车站之一。
杭州东站在浙江省 杭州市江干区天城路，为上海铁路局管辖个车站。经过铁路有沪昆铁路、沪杭客运专线、杭甬客运专线、宁杭客运专线、杭长客运专线。