425 黑色冲击！黑暗组织魔爪伸来的瞬间
427 充满神秘的上学之路（前篇）
428 充满神秘的上学之路（后篇）
462 黑衣组织的影子 年幼的目击者
463 黑衣组织的影子 奇妙的照明
464 黑衣组织的影子 谜样的高额报酬
465 黑衣组织的影子 珍珠的流星
484黑色照片的行踪（前篇）
485黑色照片的行踪（后篇）
491 红与黑的碰撞 开端
492 红与黑的碰撞 血缘
493 红与黑的碰撞 绝叫
494 红与黑的碰撞 冥土
495 红与黑的碰撞 昏睡
496 红与黑的碰撞 侵入
497 红与黑的碰撞 觉醒
498 红与黑的碰撞 搅乱
499 红与黑的碰撞 伪装
500 红与黑的碰撞 遗言
501 红与黑的碰撞 嫌疑
502 红与黑的碰撞 洁白
503 红与黑的碰撞 决死
504 红与黑的碰撞 殉职
509 红白黄色与侦探团
510 柯南VS W暗号之谜
511 推理对决！新一VS冲矢昴
数码重映版
与黑衣组织的再会
真人版
2.工藤新一的复活 黑暗组织的对决
剧场版
2001 剧场版5：通往天国的倒计时（天国へのカウントダウン）2001/04/11
2009 剧场版13：漆黑的追迹者（漆黒の追迹者） 2009/04/18
漫画版
01/01 001 现代的福尔摩斯
01/02 002 变成小孩子的名侦探
12/04 114 突如其来的遭遇
12/05 115 炸弹的下落
12/06 116 柯南失算了
18/06 176 转学生
18/07 177 黑衣女郎
18/08 178 秘密组织成员·
18/09 179 伪装的少女
18/10 180 将死
19/01 181 为什么？
19/09 189 被狙击的球！
19/10 190 5万6千名人质
20/01 191 远方之眼
24/07 238 背叛的街角
24/08 239 漆黑的丧葬行列
24/09 240 不告而别
24/10 241 来自过去的子弹
24/11 242 白色世界
29/03 287 看不见的恐怖
29/04 288 危险讯号
29/05 289 光天化日下的埋
34/11 350 金苹果（1）
35/01 351 金苹果（2）
35/02 352 金苹果（3）
35/03 353 金苹果（4）
35/04 354 金苹果（5）
37/05 377 黑暗的足迹（1）
37/06 378 黑暗的足迹（2）
37/07 379 黑暗的足迹（3）
37/08 380 白雪…黑影…
37/09 381 危险的相遇
37/10 382 顺风车
38/01 383 新兵器！
41/10 423 到访者留下的谜
41/11 424 小小密室的秘密
42/01 425 隐藏的真相
42/05 429 月圆之夜和黑宴
42/06 430 染血的幽灵船
42/07 431 隐形人出现
42/08 432 工藤新一登场
42/09 433 面具下的真相
42/10 434 腐坏的苹果
48/09 499 门铃怪客
48/10 500 新的黑衣组织成员
49/01 501 追踪目标！
49/02 502 新的指令！
49/03 503 黑衣组织vsFBI
49/04 504 黑衣组织vsFBI
53/07 550 目击者一人
53/08 551 钉子与蛇
53/09 552 锤子的真面目
53/10 553 不可思议的兼职
54/01 554 晚餐的菜单
54/02 555 梦中之星
FILE.595 乌鸦之歌
FILE.596 第二条线
FILE.597 假患者
VOL.58
FILE.598 跟踪，然后……
FILE.599 赤井的过去
FILE.600 孤注一掷
FILE.601 伪装
FILE.602 最终手段
FILE.603 任务
FILE.604 姐弟
FILE.605 意外的嫌疑人
FILE.606 13日又是星期五
FILE.607 卡迈尔的过去
FILE.608 魔法的咒语
VOL.59
FILE.609 钢楔
VOL.65 FILE.700 危险地带
VOL.65 FILE.701 红色与13件的暗示
VOL.66 FILE.702 炸弹犯的目的
黑衣组织（原文：黒の组织），柯南称其为“乌鸦军团”，是《名侦探柯南》中的一个笼罩在神秘色彩中的犯罪组织。主角工藤新一因为看到了组织与他人的非法交易而遭下毒变小为江户川柯南。
实际上，这个组织的真实名称一直是一个谜，在片中往往以“黑衣（黑暗）组织”、“组织”代称。组织的组成结构和目的也不明显。但可以肯定的是组织的势力遍布日本和西方国家，并且有雄厚的产业。此外，组织一直在研制某种让人致死的剧毒药物有说法说是为了让自己长身不老的药。（似乎是APTX4869，但由于研究未完成，出现了使人返老还童的效果）并且从事某种“使时光倒流”的技术（灰原哀语）。组织的成立时间不少于半个世纪（单行本19卷 FILe9 被狙击的球 TV130 竞技场无差别胁迫事件 前篇），灰原（对工藤）说：“早在半个世纪前，你就跟组织有很大关系了。”组织里的颜色是黑色，所有的人都穿这个颜色的衣服。组织里的人员的代号全部是酒名。
目前出现的比较重要的组织成员包括：Gin、Sherry（灰原哀）（已背叛组织）、Vermouth（贝尔摩德，莎朗·温亚德，克莉丝·温亚德）、Vodka、Kir（基尔）（CIA在组织中的卧底，水无怜奈被FBI送入医院后昏迷不醒）、Chianti、Korn、Calvados、Bourbon
参考资料：http://baike.baidu.com/view/757190.html?wtp=tt