遂川县国家税务局设有多个职能股室，各司其职，保障税务工作的高效运行。以下是主要部门的职责概述：
1. 办公室：负责制定年度计划、文秘、文电、会务、档案、督办、保密等工作，承担税收宣传、政务公开、后勤保障等工作，以及处理相关的人大代表建议和政协提案。
2. 人事教育股：负责落实人事管理制度，包括编制、干部任免、人事档案管理、公务员管理等，同时负责税务文化建设、人员教育和离退休干部管理工作。
3. 监察室：负责纪检监察工作，受理违法违纪行为的举报，查处案件，开展执法监察和纠风工作。
4. 税政法规股：负责税种和法律法规的政策执行，参与纳税辅导，涉外税收管理，规范性文件审核，以及税收执法检查和质量考核。
5. 收入核算股：负责年度税收计划编制，税款缴退库监督，税收分析预测，会计统计核算，机关财务管理，以及审计工作。
6. 征收管理股：组织落实税收征管法律法规，负责税务登记、纳税申报等工作，监督税控器具推广和市场税收管理。
7. 税源管理科：负责党建工作和思想政治工作，负责城区及周边地区的个体集贸业户税务管理。
8. 纳税评估科：负责纳税评估，包括一般纳税人评估、专项评估和软件推广，以及纳税辅导和投诉处理。
9. 办税服务厅：保障纳税人权益，提供辅导、咨询和法律救济服务，处理涉税事项如税务登记和纳税申报。
10. 稽查局：负责制定稽查计划，查处城区税务违法案件，以及协调司法工作。
11. 信息中心：负责信息系统建设与维护，确保“金税工程”的网络畅通和数据管理。
12. 草林、左安、衙前分局：分别负责指定区域的税务管理工作，如草林镇、左安镇、衙前镇等。
13. 机关党委办公室：负责机关的党建工作和工青妇工作，以及积极分子的教育培训和发展党员事宜。
于1994年9月税务机构分设时成立，主管全县国税工作的行政执法部门，实行上级国税机关垂直管理体制，目前设办公室、人事教育股、监察室、税政法规股、征收管理股、收入核算股6个职能股室和信息中心一个事业单位；下设税源管理科、稽查局、纳税评估科、办税服务厅及草林分局、左安分局、衙前分局7个副科级单位，全局现有干部职工74人，其中女同志14人，党员61人，有本科文凭45人，有大专文凭的32人。35岁以下年龄占15.4%，35岁以上的占84.6%，负责全县23个乡（镇）、2个国营林场、102户一般纳税人，2000多户小规模纳税人的国税征管工作。