法院经审理认为，被告人聂磊是组织、领导黑社会性质组织犯罪的首要分子，依法应对该组织所犯的全部罪行负责，且系累犯，依法应从重处罚 ；虽然其认罪态度较好，但综合全案罪行严重，决定不对其从轻处罚。法院最终依法判决：聂磊犯故意伤害罪，判处死刑，剥夺政治权利终身；犯组织、领导黑社会性质组织罪，判处有期徒刑十年；其还犯有其他罪行，数罪并罚 ，决定执行死刑 ，剥夺政治权利终身，并处没收个人全部财产。其余被告人也依法受到严惩。
被告人聂磊及其黑社会性质组织，为树立非法权威，实现“聂磊公司”在社会上长期称霸一方 ，以给组织成员购买高档车辆、发放公司报酬、装备通信工具、购置枪支弹药、给予经济补偿等手段，笼络人心，强化控制；通过拉拢、腐蚀国家工作人员(另案处理)，打压竞争对手，疏通关系，包庇 、纵容违法犯罪的组织成员逃避法律制裁 ，严重破坏经济秩序、社会生活秩序，社会危害性大。
被告人聂磊及其黑社会性质组织为取得经济支撑，先后成立全濠实业有限公司，开发、购置如意大厦、明珠花园等多处房地产 ，攫取了巨额经济利益；开设新艺城夜总会，组织妇女异性陪侍、卖淫，非法经营夜总会获利数千万元；开设地下赌场，谋取暴利；成立暴力团伙，大肆实施故意伤害、寻衅滋事等违法犯罪活动，为组织提供暴力保护。10多年来，被告人聂磊及其黑社会性质组织实施违法犯罪活动40余起，致2 人死亡、1 人重伤、13人轻伤、8人轻微伤，非法买卖枪支1支，非法持有枪支13支。
综上所述：聂磊案的指控罪项有黑社会性质组织犯罪和故意伤害罪、组织卖淫罪、开设赌场罪
法律依据：
《中华人民共和国刑事诉讼法》第十五条 犯罪嫌疑人、被告人自愿如实供述自己的罪行，承认指控的犯罪事实，愿意接受处罚的，可以依法从宽处理。
《中华人民共和国刑法》第二百九十四条 【组织、领导、参加黑社会性质组织罪】组织、领导黑社会性质的组织的，处七年以上有期徒刑，并处没收财产；积极参加的，处三年以上七年以下有期徒刑，可以并处罚金或者没收财产；其他参加的，处三年以下有期徒刑、拘役、管制或者剥夺政治权利，可以并处罚金。
《中华人民共和国刑法》第二百三十四条 【故意伤害罪】故意伤害他人身体的，处三年以下有期徒刑、拘役或者管制。犯前款罪，致人重伤的，处三年以上十年以下有期徒刑；致人死亡或者以特别残忍手段致人重伤造成严重残疾的，处十年以上有期徒刑、无期徒刑或者死刑。本法另有规定的，依照规定。
《中华人民共和国刑法》第三百五十八条 【组织卖淫罪】【强迫卖淫罪】组织、强迫他人卖淫的，处五年以上十年以下有期徒刑，并处罚金；情节严重的，处十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处罚金或者没收财产。组织、强迫未成年人卖淫的，依照前款的规定从重处罚。犯前两款罪，并有杀害、伤害、强奸、绑架等犯罪行为的，依照数罪并罚的规定处罚。
《中华人民共和国刑法》第三百零三条【开设赌场罪】开设赌场的，处五年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处罚金；情节严重的，处五年以上十年以下有期徒刑，并处罚金。
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