法律分析：商铺的房产证办理需要交纳的税费如下：
1、契税：房款的1.5%（面积在144平米以上的需要缴纳3%，面积在90平米以下并且是首套房的可以缴纳1%）。
2、印花税：印花税分为“产权转移书据”印花税和“权利许可证照”印花税。“产权转移书据”税目税率为万分之五，计税依据为书据中所载的金额，买卖双方均要交纳。“权利许可证照”税目适用5元／件的定额税率，买方交纳。
3、维修基金：购买不配备电梯房屋的购房人按75元/平方米（按房屋建筑面积计）交存。购买配备电梯房屋的购房人按120元/平方米（按房屋建筑面积计）交存。
4、交易费：3元/平方米。
5、测绘费：按各区具体规定。
6、权属登记费及取证费：按各区具体规定，一般情况是在200元内。
7、工本费：居民住宅每套80元，如有共有权证增收工本费10元/本。
法律依据：《中华人民共和国税收征收管理法》
第一条 为了加强税收征收管理，规范税收征收和缴纳行为，保障国家税收收入，保护纳税人的合法权益，促进经济和社会发展，制定本法。
第二条 凡依法由税务机关征收的各种税收的征收管理，均适用本法。
第三条 税收的开征、停征以及减税、免税、退税、补税，依照法律的规定执行律授权国务院规定的，依照国务院制定的行政法规的规定执行。
任何机关、单位和个人不得违反法律、行政法规的规定，擅自作出税收开征、停征以及减税、免税、退税、补税和其他同税收法律、行政法规相抵触的决定。
第四条 法律、行政法规规定负有纳税义务的单位和个人为纳税人。
法律、行政法规规定负有代扣代缴、代收代缴税款义务的单位和个人为扣缴义务人。纳税人、扣缴义务人必须依照法律、行政法规的规定缴纳税款、代扣代缴、代收代缴税款。