一、用途不同
1、草甘膦：广泛用于橡胶、桑、茶、果园及甘蔗地。主要抑制植物体内的烯醇丙酮基莽草素磷酸合成酶，从而抑制莽草素向苯丙氨酸、酪氨酸及色氨酸的转化，使蛋白质合成受到干扰，导致植物死亡。
2、草胺膦：使用时主要作触杀剂。施药后有效成分通过叶片起作用，尚未出土的幼苗不会受到伤害。
二、剂型含量不同
1、草甘膦：草甘膦有30%、46%水剂、30%、50%和65%、70%可溶粉剂。
2、草胺膦：6%、12%、20%水剂（60g、120g和200g氨盐／L)。
三、理化性质不同
1、草甘膦：密度：1.68g/cm3、熔点：230℃、沸点：465.83℃、闪点：235.52℃、折射率：1.529、表面张力：86.3dyne/cm、极化率：12.309×10-24cm3。
2、草胺膦：易溶于水，在一般有机溶剂中溶解性低，溶解度（20℃），对光稳定，在pH5～9水解，在土壤中DT<10天。
以上内容参考 百度百科-草胺膦
以上内容参考 百度百科-草甘膦
1、作用不同
草铵膦先杀叶，与草甘膦杀根不同，通过植物蒸腾作用可以在植物木质部进行传导，其速效性间于百草枯和草甘膦之间。
草甘膦是非选择性芽后除草剂，对多年生深根杂草，一年颧二年生禾本科杂草和莎草有特效。
2、分子式不同
草胺磷：分子式，C5H15N2O4P。
草甘磷：分子式，C3H9N·C3H8NO5P。
3、应用不同
草胺磷：用于果园、葡萄园、马铃薯田、非耕地等防治一年生和多年生双子叶及禾本科杂草，如鼠尾看麦娘、马唐、稗、野生大麦、多花黑麦草、狗尾草、金狗尾草、野小麦、野玉米、鸭芽、曲芒发草、羊茅等等。
草甘磷：通常用于玉米、棉花、大豆田和果园中，并可用于非耕地除草。
以上内容参考 百度百科-草铵膦、 百度百科-草甘膦异丙胺盐
目前，草甘膦是全球销售市场最高的除草剂，也是全世界销售额第一的农药品种，2012年其销售额达45.75亿美元。草甘膦的崛起得益于抗除草剂转基因作物的问世。抗草甘膦转基因作物的诞生，使农民大大减少了作物田中除草剂的应用，施药成本明显下降。由此，使抗草甘膦转基因作物的种植面积飞速发展，从1996年至今增长了100多倍，也导致一些农药企业不得不退出农药市场，如以生产大豆田用除草剂咪唑啉酮类的美国氰胺公司不得不将农药事业出售给德国巴斯夫公司，从而从农药市场中撤出。自此，草甘膦在农药市场中一直鳌居众多农药首位。
但是，长期种植抗草甘膦转基因作物并持续施用草甘膦后，也会出现抗性问题。例如以大豆为例，当抗草甘膦转基因大豆种植后，在收割中，会掉落大豆，并会遗留末除尽的根茬。这些大豆和根茬第二年也会长出大豆，人们称之为“自生大豆”。它们对草甘膦同样具有抗性，施用草甘膦对其毫无损害。由于它们未经选育、随意生长，并连续几年这种“自生大豆”越来越多，明显影响大豆的质量和产量。
为解决这种抗草甘膦的“自生作物（大豆）”，人们就选用种植与草甘膦作用机制截然不同的抗草铵膦的作物，并施用草铵膦灭除杂草和上述“自生作物（大豆）”。由于草铵膦的价格远高于草甘膦，以后每隔几年种植一次抗草铵膦的作物，并施用草铵膦。由此，2012年草铵膦的市场亦达4.20亿美元。通过此法，解决了抗草甘膦“自生作物”的抗性问题，也保证了作物的产量和质量。
正确认识此“二兄弟”的特性，并充分合理的使用，才能发挥它们的作用，为农作物的稳产、丰产作出贡献。
1、草甘膦是甘氨酸类，作用机理——抑制烯醇丙酮基莽草素磷酸合成酶，蛋白质合成受阻；草铵膦是膦酸类，作用机理——积铵触杀，抑制谷氨酰胺合成
2、草甘膦甘是内吸传导灭生；草铵膦铵是半内吸或内吸很弱无传导的触杀灭本回答被网友采纳
1、传导性不同
草甘膦是氨酸类，抑制烯醇丙酮基莽草素膦酸合成酶，蛋白质合成受干扰，具有内吸传导性，主要杀根；草铵膦是膦酸类，积铵触杀，抑制谷氨酰胺合成，以触杀为主，内吸较弱，先杀叶可叶片传导。
2、应用不同
草甘膦广泛用于橡胶、桑、茶、果园及甘蔗地（一般不用于浅根或根系暴露在外的作物，例如蔬菜、香菜、胡椒、葡萄、木瓜、玉米等），一般要7-9天见效，15天左右死草；
草铵膦可用于所有作物但不能喷到作物上，一般为3-5天见效，7-10天死草。
3、抗性杂草不同
草甘膦对抗性杂草如牛筋草、小飞蓬，效果不好，抗性杂草逐年增加；
草铵膦对牛筋草、小飞蓬等抗性杂草防效好，对部分地区莎草科杂草防效较差。
4、作用不同
草甘膦容易导致土壤中的微量元素缺乏，作物形成缺素症，且使用不当易出现漂移药害，影响作物生长；
草铵膦副作用比较小，对土壤无伤害，药液漂移只在接触部位产生药斑，对作物生长和产量影响不大。
以上内容参考 百度百科—草铵膦、百度百科—草甘膦、人民网—专家：相比其它除草剂 草甘膦的安全性是最高的
本回答被网友采纳1、作用不同
草铵膦先杀叶，与草甘膦杀根不同，通过植物蒸腾作用可以在植物木质部进行传导，其速效性间于百草枯和草甘膦之间。
草甘膦异丙胺盐是非选择性芽后除草剂，对多年生深根杂草，一年颧二年生禾本科杂草和莎草有特效。
2、分子式不同
草胺磷：分子式，C5H15N2O4P。
草甘磷异丙胺盐：分子式，C3H9N·C3H8NO5P。
3、应用不同
草胺磷：用于果园、葡萄园、马铃薯田、非耕地等防治一年生和多年生双子叶及禾本科杂草，如鼠尾看麦娘、马唐、稗、野生大麦、多花黑麦草、狗尾草、金狗尾草、野小麦、野玉米、鸭芽、曲芒发草、羊茅等等。
草甘磷异丙胺盐：通常用于玉米、棉花、大豆田和果园中，并可用于非耕地除草。